Поиск мотивов в последовательности BFR_ECOLI с помощью средств PROSITE
 В базе данных PROSITE собрана коллекция сайтов, мотивов и доменов. Они описаны с помощью паттернов. С помощью программы ScanProsite (Scan a protein for PROSITE matches) было найдено 5 известных мотивов в последовательности BFR_ECOLI.
Идентифи-катор паттерна (accession number) Идентификатор документации PROSITE и краткое описание или название паттерна в соответствии с этим документом Паттерн (регулярное выражение) Число мотивов, обнаруженных в моем белке
PS00001* PDOC00001, сайт N-гликозилирования N-{P}-[ST]-{P} 10
PS00006* PDOC00003, сайт II фосфорилирования казеиновой киназы [ST]-x(2)-[DE] 3
PS00003 PDOC00003 сайт тиразин сульфатирования
Правила:
  1. Glu or Asp между двумя остатками Tyr
    (как правило на -1 позиции)

  2. Как минимум три кислотных остатка в области от -5 до +5

  3. Не более 1 основного и 3 гидрофобных от -5 до +5

  4. Как минимум один Pro или Gly от -7 до -2 и от +1 до +7 или как минимум 2 или 3 Asp, Ser or Asn от -7 до +7

  5. Отсутствие связанного дисульфидными связями Cys от -7 до +7

  6. Отсутствие азот-связанных глюканов около тирозина

 1
PS00007* PDOC00007, сайт фосфорилирования тиразин киназы [RK]-x(2,3)-[DE]-x(2,3)-Y 2
PS00549** PDOC00475, ферритиновая подпись M-x-G-x(3)-[IV]-[LIV]-x(2)-[LM]-x(3)-L-x(3)-L 1
* - отмечены часто встречающиеся не специфические в белках мотивы
** - отмечен паттерн мотива, для которого в PROSITE есть еще и профиль
Последовательность, соответствующая паттерну подписи
MAGKLQIVAKLQTWLFPYL
НА ГЛАВНУЮ