На страничку первого семестра


Скрипт к занятию 14

Контакты в структуре белка



Примеры разных контактов в молекуле белка IOLI_BACSU.

  • Пример гидрофобного контакта


  • Наиболее вероятно наличие гидрофобных контактов между следующими аминокислотными остатками:
    1)phe143, phe154, phe178, leu188
    2)phe71, leu125, leu141
    3)leu20, leu51, phe55
    4)phe176, phe207, leu212
    5)phe86, leu128
    6)phe70, val107
    Гидрофобных контактов у боковых групп остальных фенилаланинов не наблюдается.

    Наибольшее число гидрофобных контактов у остатка Phe178.

    На картинке в центре показан Phe178
    Вокруг него в проволочной модели показаны
    аминокислотные остатки, с которыми Phe178
    предположительно образует гидрофобные контакты
    Шариками среднего размера показаны атомы аминокислотных остатков,
    расположенные от Phe178 в радиусе 5Å

    Скорее всего, гидрофобное взаимодействие имеется между
    боковыми группами следующих аминокислотных остатков:
    Phe178, Ile185, Leu188, Phe154, Leu173, Phe143
  • Примеры водородных связей между боковыми группами


  • Водородная связь между атомами кислорода
    боковых групп Ser244 и Glu32

    Водородная связь между атомами азота
    боковой группы His146 и остова Pro147
  • Примеры дисульфидных мостиков в инсулине


  • Дисульфидный мостик в инсулине

    Дисульфидные мостики в инсулине


    В белке IOLI_BACSU нет дисульфидных мостиков






    © Karavaeva Julia 2009