Анализ в поисковых системах

Сравнение поисковых систем

При сравнении поисковых систем SRS, MRS и UniProt наиболее благоприятными по восприятию показались

мне MRS и UniProt. В них информация, на мой взгляд, показалась более структурированной, интерфейс

более удобным. Однако в SRS присутствуют такие поля данных, как Keywords и Protein Existence, а также

есть ссылки на статьи по белку и указана свобода доступа к ним. База UniProt отличается по структуре.

В ней находится поле данных Relevant documents, так же есть расшифровка обозначение полей и их содержимого.

Вся информация о вторичной структуре имеется в отдельной схеме. Расшифровка поля Features объеденяет ее с

базой SRS(в ней все участки в одной схеме,а в UnipRot участки на отдельных. Больше всего мне понравилась база данных MRS.

Работа с полем Taxonomy банка SwissProt в SRS

Информация о поле Taxonomy в SRS:This field indexes the OC lines. The OC (Organism Classification) lines

contain the taxonomic classification of the source organism. It is indexed as single words.

На gam в Taxonomy в SRS упоминаются gammaproteobacteria, gammaridea, gammaherpesvirinae, gambusia,

gammaretrovirus, gammapapillomavirus.

Английский эквивалент «гамма-протеобактерии» – «gammaproteobacteria»

Записей,упоминающих белки из гамма-протеобактерий, в банке SwissProt 83513.

Поиск белков гамма-протеобактерий в SRS

Запросы на поиск белков гамма-протеобактерий, выполняющих сходную функуцию с белком SYC_ECOLI

Последовательности, обнаруженные по запросу ([swissprot-Taxonomy:gammaproteobacteria] &

[swissprot-Description:Cysteinyl-tRNA synthetase]).

Medline

1.По запросу ([medline-Year#2006:2009] & [medline-Abstract:Cysteinyl-tRNA synthetase]) найдено 12 статей.

2.По запросу ([medline-Year#1970:1979] & [medline-Authors:Neyfakh,A.A]) выяснила, что 9 статей

опубликованны в 1970-е годы, среди авторов которых имеется А.А.Нейфах

Статьи посвящены миграции синтезированной РНК в течении митоза, а так же реализации генетической информации на ранних этапах развития.