Исследование вторичной структуры белка ESTA_Bacsu
Количество
α-спиралей:10
β-складок: 10
β-поворотов: 19
ESTA_Bacsu относится к α/β-белкам,т.к. содержит две разные чередующиеся структуры:α-спирали и β-тяжи.
Самая длинная спираль: ASN 48 - LEU 63 Chain: A
Самая длинная пара соседних антипараллельных бета-тяжей(данный элемент отсутсвует в белке, использована структура 1bs2.ent):1)149-169 2)151-166
Самая длинная пара соседних параллельных бета-тяжей: 1)6-9 2)36-38
Для исследования выбраны элементы вторичной структуры:
alpha-спираль 48-63
beta-тяж 6-9 соседние: 36-38 и 71-76
beta-поворот 113-122
1.Картинки, иллюстрирующие свойства выбранной альфа-спирали
Паттерн H-связей:H(51,55),H(54,58).Обобщенный паттерн:j=i+4 , i=(48,59)
Атомы Cβ расположены вне плоскости спирали.
2.Картинки, иллюстрирующие свойства выбранного бета-тяжа
Атомы Cβ расположены снаружи от остова бета-тяжа.
3.Изображение реверсивного поворота
Есть H-связь,способная скрепить поворот(между O GLY116 и N ASN120).
© Yulya Naraykina, 2009