Главная страница

Консервативные аминокислотные остатки в выборке 10 потенциальных гомологов PHOQ_ECOLI

Матрица попарного сходства последовательностей выборки

       

                RESE_BACSU     YYCG_BACSU  BAES_ECOLI   CIAH_STRR6   RSTB_ECOLI   CUSS_ECO57   COPS_PSESM   PHOQ_ECOLI   PRRB_MYCBO   SASA_PROMA   CSSS_BACSU 

  RESE_BACSU          100%                                                                                                                                  

  YYCG_BACSU           28%         100%                                                                                                                     

  BAES_ECOLI           15%          15%         100%                                                                                                        

  CIAH_STRR6           14%          14%          15%         100%                                                                                           

  RSTB_ECOLI           12%          11%          16%          15%         100%                                                                              

  CUSS_ECO57           12%          12%          17%          15%          17%         100%                                                                 

  COPS_PSESM           10%           9%          17%          13%          14%          25%         100%                                                    

  PHOQ_ECOLI           11%          10%          12%          14%          15%          12%          12%         100%                                       

  PRRB_MYCBO            9%          11%          13%          11%          14%          10%          10%          12%         100%                          

  SASA_PROMA           10%          11%          11%          12%          15%          12%          11%          12%          12%         100%             

  CSSS_BACSU           10%           9%          16%          10%          12%          12%          10%          11%          12%           8%         100%


                                        Множественное выравнивание белков выборки

                                                                                                                                                 
                                                    *                 2 0                   *                 4 0                   *            
R E S E _ B A C S U       1   :   - - - M K F W K S V V G K L W F T I L S L V L I V L F I L T V L L L E F I E N Y H V E E A E N D L T   :     4 7
Y Y C G _ B A C S U       1   :   M N K V G F F R S I Q F K I T L I Y V L L I I I A M Q I I G V Y F V N Q V E K S L I S S Y E Q S L N   :     5 0
B A E S _ E C O L I       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
C I A H _ S T R R 6       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R S T B _ E C O L I       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
C U S S _ E C O 5 7       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
C O P S _ P S E S M       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
P H O Q _ E C O L I       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
P R R B _ M Y C B O       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
S A S A _ P R O M A       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
C S S S _ B A C S U       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
                                                                                                                                                 
                                                                                                                                                 
                                                  6 0                   *                 8 0                   *               1 0 0            
R E S E _ B A C S U     4 8   :   Q L A N K V A V I L E N H E D Q A L A R S I T W E L A D N L T S I A I I Q D E K N H W Y S P N D K N   :     9 7
Y Y C G _ B A C S U     5 1   :   Q R I D N L S Y Y I E Q E Y K S D N D S T V I K D D V S R I L N D F T K S D E V R E I S F V D K S Y   :   1 0 0
B A E S _ E C O L I       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
C I A H _ S T R R 6       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R S T B _ E C O L I       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
C U S S _ E C O 5 7       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
C O P S _ P S E S M       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
P H O Q _ E C O L I       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
P R R B _ M Y C B O       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
S A S A _ P R O M A       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
C S S S _ B A C S U       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
                                                                                                                                                 
                                                                                                                                                 
                                                    *               1 2 0                   *               1 4 0                   *            
R E S E _ B A C S U     9 8   :   R L S S I T V E Q I Q H D K - - - - - D L N K A L K D H K K V S K R T G L S D T D T D N E R L I V G   :   1 4 2
Y Y C G _ B A C S U   1 0 1   :   E V V G S S K P Y G E E V A G K Q T T D L I F K R I F S T K Q S Y L R K Y Y D P K S K I R V L I S A   :   1 5 0
B A E S _ E C O L I       1   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M K F W R P G I T G K L F L A I F A T   :     1 9
C I A H _ S T R R 6       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
R S T B _ E C O L I       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
C U S S _ E C O 5 7       1   :   - - - - - - - - - - - - - - - M V S K P F Q R P F S L A T R L T F F I S L A T I A A F F A F A W I M   :     3 5
C O P S _ P S E S M       1   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M K P G S L T L R L   :     1 0
P H O Q _ E C O L I       1   :   - - - - - - - - - - M K K L L R L F F P L S L R V R F L L A T A A V V L V L S L A Y G M V A L I G Y   :     4 0
P R R B _ M Y C B O       1   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M N I   :       3
S A S A _ P R O M A       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
C S S S _ B A C S U       1   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M K N K P L A F Q I W V V   :     1 3
                                                                                                                                                 
                                                                                                                                                 
                                                1 6 0                   *               1 8 0                   *               2 0 0            
R E S E _ B A C S U   1 4 3   :   V P Y E K D G K - - K G M V F L S Q S L L A V K D T T K H T T R Y I F L A A G I A I V L T T F F A F   :   1 9 0
Y Y C G _ B A C S U   1 5 1   :   K P V M T E N Q E V V G A I Y V V A S M E D V F N Q M K T I N T I L A S G T G L A L V L T A L L G I   :   2 0 0
B A E S _ E C O L I     2 0   :   C I V L L I S M H W A V R I S F E R G F I D Y I K H G N E Q R L Q L L S D A L G E Q Y A Q H G N W R   :     6 9
C I A H _ S T R R 6       1   :   - - - - - - - - - M F S K L K K T W Y A D D F S Y F I R N F G V F T L I F S T M T L I I L Q V M H S   :     4 1
R S T B _ E C O L I       1   :   - - - - - - - - - - - - - - - - M K K L F I Q F Y L L L F V C F L V M S L L V G L V Y K F T A E R A   :     3 4
C U S S _ E C O 5 7     3 6   :   I H S V K V H F A E Q D I N D L K E I S A T L E R V L N H P D E T Q A R R L M T L E D I V S G Y S N   :     8 5
C O P S _ P S E S M     1 1   :   S L L F V V A V A A V L I I V G V A F N E L S R H H F R A L D A Q A L G E K L E A I T Q I A K E S G   :     6 0
P H O Q _ E C O L I     4 1   :   S V S F D K T T F R L L R G E S N L F Y T L A K W E N N K L H V E L P E N I D K Q S P T M T L I Y D   :     9 0
P R R B _ M Y C B O       4   :   L S R I F A R T P S L R T R V V V A T A I G A A I P V L I V G T V V W V G I T N D R K E R L D R R L   :     5 3
S A S A _ P R O M A       -   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :       -
C S S S _ B A C S U     1 4   :   I S G I L L A I S I L L L V L F S N T L R D F F T N E T Y T T I E N E Q H V L T E Y R L P G S I E R   :     6 3
                                                                                                                                                 
                                                                                                                                                 
                                                    *               2 2 0                   *               2 4 0                   *            
R E S E _ B A C S U   1 9 1   :   F L S S R V T Y P L R K M R E G A Q D L A K G K F D T K I P I L T Q D E I G E L A T A F N Q M G R Q   :   2 4 0
Y Y C G _ B A C S U   2 0 1   :   F L A R T I T H P L S D M R K Q A M E L A K G N F S R K V K K Y G H D E I G Q L A T T F N H L T R E   :   2 5 0
B A E S _ E C O L I     7 0   :   F L R N N D R F V F Q I L R S F E H D N S E D K P G P G M P P H G W R T Q F W V V D Q N N K V L V G   :   1 1 9
C I A H _ S T R R 6     4 2   :   S L Y T S V D D K L H G L S E N P Q A V I Q L A I N R A T E E I K D L E N A R A D A S K V E I K P N   :     9 1
R S T B _ E C O L I     3 5   :   G K Q S L D D L M N S S L Y L M R S E L R E I P P H D W G K T L K E M D L N L S F D L R V E P L S K   :     8 4
C U S S _ E C O 5 7     8 6   :   V L I S L A D S H G K T V Y H S P G A P D I R E F A R D A I P D K D A R G G E V F L L S G P T M M M   :   1 3 5
C O P S _ P S E S M     6 1   :   A N P E L L K A R W H T L L G A H P D L S A V F L K T D G T P F F A E P P Q S A V P S L A Q A T Q R   :   1 1 0
P H O Q _ E C O L I     9 1   :   E N G Q L L W A Q R D V P W L M K M I Q P D W L K S N G F H E I E A D V N D T S L L L S G D H S I Q   :   1 4 0
P R R B _ M Y C B O     5 4   :   D E A A G F A I P F V P R G L D E I P R S P N D Q D A L I T V R R G N V I K S N S D I T L P K L Q D   :   1 0 3
S A S A _ P R O M A       1   :   - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M N K A T A N E R K K L R L L L V A S R   :     2 0
C S S S _ B A C S U     6 4   :   R Y Y S E E A T A P T T V R S V Q H V L L P E N E E A S S D K D L S I L S S S F I H K V Y K L A D K   :   1 1 3
                                                                                                                                                 
                                                                                                                                                 
                                                2 6 0                   *               2 8 0                   *               3 0 0            
R E S E _ B A C S U   2 4 1   :   L N F H I N A L N Q E K E Q L S N I L S S M A D G V I T I N I D G T I L V T N P P A E R F L Q A W Y   :   2 9 0
Y Y C G _ B A C S U   2 5 1   :   L E D A Q A M T E G E R R K L A S V I A Y M T D G V I A T N R N G A I I L L N S P A L E L L N V S R   :   3 0 0
B A E S _ E C O L I   1 2 0   :   P R A P I P P D G T R R P I L V N G A E V G A V I A S P V E R L T R N T D I N F D K Q Q R Q T S W L   :   1 6 9
C I A H _ S T R R 6     9 2   :   V S S N T E V I L F D K D F T Q L L S G N R F L G L D K I K L E K K E L G H I Y Q I Q V F N S Y G Q   :   1 4 1
R S T B _ E C O L I     8 5   :   Y H L D D I S M H R L R G G E I V A L D D Q Y T F L Q R I P R S H Y V L A V G P V P Y L Y Y L H Q M   :   1 3 4
C U S S _ E C O 5 7   1 3 6   :   P G H G H G H M E H S N W R M I S L P V G P L V D G K P I Y T L Y I A L S I D F H L H Y I N D L M N   :   1 8 5
C O P S _ P S E S M   1 1 1   :   D G V W E W E K E G R M F R A L T A S V S - L P T A S P P L T A W L V L D V T T H M H F F A M L E R   :   1 5 9
P H O Q _ E C O L I   1 4 1   :   Q Q L Q E V R E D D D D A E M T H S V A V N V Y P A T S R M P K L T I V V V D T I P V E L K S S Y M   :   1 9 0
P R R B _ M Y C B O   1 0 4   :   D Y A D T Y V R G V R Y R V R T V E I P G P E P T S V A V G A T Y D A T V A E T N N L H R R V L L I   :   1 5 3
S A S A _ P R O M A     2 1   :   K H L S R G D L R S L I R F L E S E D C G F E I K L Q F S D P K E Q P E L L E L H R L V A I P A L I   :     7 0
C S S S _ B A C S U   1 1 4   :   Q E A K K K R Y S A D V N G E K V F F V I K K G L S V N G Q S A M M L S Y A L D S Y R D D L A Y T L   :   1 6 3
                                                                                                                                                 
                                                                                                                                                 
                                                    *               3 2 0                   *               3 4 0                   *            
R E S E _ B A C S U   2 9 1   :   Y E Q N M N I K E G D N L P P E A K E L F Q N A V S T E K E Q M I E M T L Q G R S W V L L M S P - -   :   3 3 8
Y Y C G _ B A C S U   3 0 1   :   - E T A L E M P I T S L L G L Q E N Y T F E D L V E Q Q D S M L L E I E R D D E L T V L R V N F S V   :   3 4 9
B A E S _ E C O L I   1 7 0   :   I V A L A T L L A A L A T F L L A R G L L A P V K R L V D G T H K L A A G D F T T R V T P T S E - -   :   2 1 7
C I A H _ S T R R 6   1 4 2   :   E E I Y R V I L M E T N I S S V S T N I K Y A A V L I N T S Q L E Q A S Q K H E Q L I V V V M A S -   :   1 9 0
R S T B _ E C O L I   1 3 5   :   R L L D I A L I A F I A I S L A F P V F I W M R P H W Q D M L K L E A A A Q R F G D G H L N E R I H   :   1 8 4
C U S S _ E C O 5 7   1 8 6   :   K L I M T A S V I S I L I V F I V L L A V H K G H A P I R S V S R Q I Q N I T S K D L D V R L D P -   :   2 3 4
C O P S _ P S E S M   1 6 0   :   W F W G V L L A S T V L S A A L G W L V A K N G L R P V A R V T Q T A A S M S A G S L K E R I P - L   :   2 0 8
P H O Q _ E C O L I   1 9 1   :   V W S W F I Y V L S A N L L L V I P L L W V A A W W S L R P I E A L A K E V R E L E E H N R E L L N   :   2 4 0
P R R B _ M Y C B O   1 5 4   :   C T F A I G A A A V F A W L L A A F A V R P F K Q L A E Q T R S I D A G D E A P R V E V H G A S E A   :   2 0 3
S A S A _ P R O M A     7 1   :   K L D P Q P K Q I F A G T S I L E Q L K N W L P R W E Q E D I L I S S G L G I N L R Q K E S E N G R   :   1 2 0
C S S S _ B A C S U   1 6 4   :   F K Q L L F I I A V V I L L S W I P A I W L A K Y L S R P L V S F E K H V K R I S E Q D W D D P V K   :   2 1 3
                                                                                                                                                 
                                                                                                                                                 
                                                3 6 0                   *               3 8 0                   *               4 0 0            
R E S E _ B A C S U   3 3 9   :   - L Y A E S H V R G A V A V L R D M T E E R R L D K L R E D F I A N V S H E L R T P I S M L Q G Y S   :   3 8 7
Y Y C G _ B A C S U   3 5 0   :   I Q R E H G K I D G L I A V I Y D V T E Q E K M D Q E R R E F V A N V S H E L R T P L T T M R S Y L   :   3 9 9
B A E S _ E C O L I   2 1 8   :   - - - - D E L G K L A Q D F N Q L A S T L E K N Q Q M R R D F M A D I S H E L R T P L A V L R G E L   :   2 6 3
C I A H _ S T R R 6   1 9 1   :   - F W I L S L L A S L Y L A R V S V R P L L E S M Q K Q Q S F V E N A S H E L R T P L A V L Q N R L   :   2 3 9
R S T B _ E C O L I   1 8 5   :   F D E G S S F E R L G V A F N Q M A D N I N A L I A S K K Q L I D G I A H E L R T P L V R L R Y R L   :   2 3 4
C U S S _ E C O 5 7   2 3 5   :   Q T V P I E L E Q L V L S F N H M I E R I E D V F T R Q S N F S A D I A H E I R T P I T N L I T Q T   :   2 8 4
C O P S _ P S E S M   2 0 9   :   E P V P D E L R A L I T A F N S M L G R L D D S F M R L S N F S A D I A H E L R T P I S N L R T H T   :   2 5 8
P H O Q _ E C O L I   2 4 1   :   P A T T R E L T S L V R N L N R L L K S E R E R Y D K Y R T T L T D L T H S L K T P L A V L Q S T L   :   2 9 0
P R R B _ M Y C B O   2 0 4   :   I E I A E A M R G M L Q R I W N E Q N R T K E A L A S A R D F A A V S S H E L R T P L T A M R T N L   :   2 5 3
S A S A _ P R O M A   1 2 1   :   T R N E L L L E D E N L V L R Q E N E T L S N Q I E S Q E R L L R M V A H E L R T P L S A A K L A L   :   1 7 0
C S S S _ B A C S U   2 1 4   :   V D R K D E I G K L G H T I E E M R Q K L V Q K D E T E R T L L Q N I S H D L K T P V M V I R G Y T   :   2 6 3
                                                                                                          H e l r T P                            
                                                                                                                                                 
                                                    *               4 2 0                   *               4 4 0                   *            
R E S E _ B A C S U   3 8 8   :   E A I V D D I A S S E E D R K E I A Q I I Y D E S L R M G R L V N D L L D L A R M E S G H T G L H Y   :   4 3 7
Y Y C G _ B A C S U   4 0 0   :   E A L A E G A W E N K D I A P R F L M V T Q N E T E R M I R L V N D L L Q L S K F D S K D Y Q F N R   :   4 4 9
B A E S _ E C O L I   2 6 4   :   E A I Q D G V R - - - K F T P E T V A S L Q A E V G T L T K L V D D L H Q L S M S D E G A L A Y Q K   :   3 1 0
C I A H _ S T R R 6   2 4 0   :   E T L F R K P E A T I M D V S E S I A S S L E E V R N M R F L T T S L L N L A R R D D G - - - I K P   :   2 8 6
R S T B _ E C O L I   2 3 5   :   E M S D N L S A - - - - - - - A E S Q A L N R D I S Q L E A L I E E L L T Y A R L D R P Q N E L H L   :   2 7 7
C U S S _ E C O 5 7   2 8 5   :   E I A L S Q S R - S Q K E L E D V L Y S N L E E L T R M A K M V S D M L F L A Q A D N N Q L I P E K   :   3 3 3
C O P S _ P S E S M   2 5 9   :   E V I L A K K R - A P E V Y E E N L S S N L E E L N R L S G I I D G M L F L A K S D N G L I V P E A   :   3 0 7
P H O Q _ E C O L I   2 9 1   :   R S L R S E K M S - - - - V S D A E P V M L E Q I S R I S Q Q I G Y Y L H R A S M R G G - T L L S R   :   3 3 5
P R R B _ M Y C B O   2 5 4   :   E V L S T L D L P - - - - - D D Q R K E V L N D V I R T Q S R I E A T L S A L E R L A Q G E L S T S   :   2 9 8
S A S A _ P R O M A   1 7 1   :   Q S Q A L G Q I D - - - - - L I K L Q E V V K R R L E E I E S L S K D L L E V G T T R W E A L F N P   :   2 1 5
C S S S _ B A C S U   2 6 4   :   Q S I K D G I F P - K G D L E N T V D V I E C E A L K L E K K I K D L L Y L T K L D Y L - - A K Q K   :   3 1 0
                                                                                                        l                                        
                                                                                                                                                 
                                                4 6 0                   *               4 8 0                   *               5 0 0            
R E S E _ B A C S U   4 3 8   :   E K I N V N E F L E K I I R K F S G V A K E K N I A L D H D I S L T E E E F M F D E D K M E Q V F T   :   4 8 7
Y Y C G _ B A C S U   4 5 0   :   E W I Q I V R F M S L I I D R F E - M T K E Q H V E F I R N L P D R D L Y V E I D Q D K I T Q V L D   :   4 9 8
B A E S _ E C O L I   3 1 1   :   A P V D L I P L L E V A G G A F R E R F A S R G L K L Q F S L P D S - I T V F G D R D R L M Q L F N   :   3 5 9
C I A H _ S T R R 6   2 8 7   :   E L A E V P T S F F N T T F T N Y E M I A S E N N R V F R F E N R I H R T I V T D Q L L L K Q L M T   :   3 3 6
R S T B _ E C O L I   2 7 8   :   S E P D L P L W L S T H L A D I Q A V T P D K T V R I K T L V Q G H - - Y A A L D M R L M E R V L D   :   3 2 5
C U S S _ E C O 5 7   3 3 4   :   K M L N L A D E V G K V F D F F E A L A E D R G V E L Q F V G D E C - - Q V A G D P L M L R R A L S   :   3 8 1
C O P S _ P S E S M   3 0 8   :   V E L D L R T V I S K L F G Y Y E F L A E D K G I Q L Q A S G N A S - - - I F A D S V M I D R V V S   :   3 5 4
P H O Q _ E C O L I   3 3 6   :   E L H P V A P L L D N L T S A L N K V Y Q R K G V N I S L D I S P E - I S F V G E Q N D F V E V M G   :   3 8 4
P R R B _ M Y C B O   2 9 9   :   D D H V P V D I T D L L D R A A H D A A R I Y P D L D V S L V P S P T C I I V G L P A G L R L A V D   :   3 4 8
S A S A _ P R O M A   2 1 6   :   Q E A N L A N I A A E V I L E L E K F W L S R G I G I N T D I P A D L P N V F A D Q S R M K Q V L L   :   2 6 5
C S S S _ B A C S U   3 1 1   :   V Q H D M F S I V E V T E E V I E R L K W A R K E L S W E I D V E E D I L M P G D P E Q W N K L L E   :   3 6 0
                                                                                                                  d                              
                                                                                                                                                 
                                                    *               5 2 0                   *               5 4 0                   *            
R E S E _ B A C S U   4 8 8   :   N L I D N A L R H T S A G G S V S I S V H S V K D G - - L K I D I K D S G S G I P E E D L P F I F E   :   5 3 5
Y Y C G _ B A C S U   4 9 9   :   N I I S N A L K Y S P E G G H V T F S I D V N E E E E L L Y I S V K D E G I G I P K K D V E K V F D   :   5 4 8
B A E S _ E C O L I   3 6 0   :   N L L E N S L R Y T D S G G S L Q I S A G Q R D K T - - V R L T F A D S A P G V S D D Q L Q K L F E   :   4 0 7
C I A H _ S T R R 6   3 3 7   :   I L F D N A V K Y T E E D G E I D F L I S A T D R N - - L Y L L V S D N G I G I S T E D K K K I F D   :   3 8 4
R S T B _ E C O L I   3 2 6   :   N L L N N A L R Y C H S T V E T S L L L S G N R A T - - - - L I V E D D G P G I A P E N R E H I F E   :   3 7 1
C U S S _ E C O 5 7   3 8 2   :   N L L S N A L R Y T P P G E A I V V R C Q T V D H L - - V Q V I V E N P G T P I A P E H L P R L F D   :   4 2 9
C O P S _ P S E S M   3 5 5   :   N L L S N A L R Y T S S G E T I K V S I H D H G G R - - V E L R L E N P G P E I V P Q H L D R I F D   :   4 0 2
P H O Q _ E C O L I   3 8 5   :   N V L D N A C K Y C L E F V E I S A R Q T D E H L Y - - - - I V V E D D G P G I P L S K R E V I F D   :   4 3 0
P R R B _ M Y C B O   3 4 9   :   N A I A N A V K H G G A T L V Q L S A V S S R A G V - - - E I A I D D N G S G V P E G E R Q V V F E   :   3 9 5
S A S A _ P R O M A   2 6 6   :   N L I E N A L K F S N D G D T V E I T M L H R T N Q - W V Q I S V S D K G P G I P E E E Q Q R I F L   :   3 1 4
C S S S _ B A C S U   3 6 1   :   N I L E N Q I R Y A E T K I E I S M K Q D D R N I V - - - - I T I K N D G P H I E D E M L S S L Y E   :   4 0 6
                                  n       N a                                                             g     i                 f              
                                                                                                                                                 
                                                5 6 0                   *               5 8 0                   *               6 0 0            
R E S E _ B A C S U   5 3 6   :   R F Y K A D K A R T R G R A G T G L G L A I V K N I V E A H N G S I T V H S R I D K G T T F S F Y I   :   5 8 5
Y Y C G _ B A C S U   5 4 9   :   R F Y R V D K A R T R K L G G T G L G L A I A K E M V Q A H G G D I W A D S I E G K G T T I T F T L   :   5 9 8
B A E S _ E C O L I   4 0 8   :   R F Y R T E G S R N R A S G G S G L G L A I C L N I V E A H N G R I I A A H S P F G G V S I T V E L   :   4 5 7
C I A H _ S T R R 6   3 8 5   :   R F Y R V D K A R T R Q K G G F G L G L S L A K Q I V D A L K G T V T V K D N K P K G T I F E V K I   :   4 3 4
R S T B _ E C O L I   3 7 2   :   P F V R L D P S R D R S T G G C G L G L A I V H S I A L A M G G T V N C D T S E L G G A R F S F S W   :   4 2 1
C U S S _ E C O 5 7   4 3 0   :   R F Y R V D P S R Q R K G E G S G I G L A I V K S I V V A H K G T V A V T S N - A R G T R F V I V L   :   4 7 8
C O P S _ P S E S M   4 0 3   :   R F Y R V D P A R - R E G R E C G A G A S D C P V L D A S A W R H Y L V Y I P R G P N D L H P H L H   :   4 5 1
P H O Q _ E C O L I   4 3 1   :   R G Q R V D T L R - - - - P G Q G V G L A V A R E I T E Q Y E G K I V A G E S M L G G A R M E V I F   :   4 7 6
P R R B _ M Y C B O   3 9 6   :   R F S R G S T A S - - - H S G S G L G L A L V A Q Q A Q L H G G T A S L E N S P L G G A R L V L R L   :   4 4 2
S A S A _ P R O M A   3 1 5   :   D R V R L P Q T S N - E T S G F G I G L S V C R R I V E V H G G K I W V V S Q P G E G S C F Y F T V   :   3 6 3
C S S S _ B A C S U   4 0 7   :   P F N K G K K G E - - - - - - F G I G L S I V K R I L T L H K A S I S I E N D K T G V S Y R I A V P   :   4 5 0
                                    f   r                     g   G   G l                       g                     g                          
                                                                                                                     
                                                    *               6 2 0                   *                        
R E S E _ B A C S U   5 8 6   :   P T K R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :   5 8 9
Y Y C G _ B A C S U   5 9 9   :   P Y K E E Q E D D W D E A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :   6 1 1
B A E S _ E C O L I   4 5 8   :   P L E R D L Q R E V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :   4 6 7
C I A H _ S T R R 6   4 3 5   :   A I Q T P S K K K K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :   4 4 4
R S T B _ E C O L I   4 2 2   :   P L W H N I P Q F T S A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :   4 3 3
C U S S _ E C O 5 7   4 7 9   :   P E R G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :   4 8 2
C O P S _ P S E S M   4 5 2   :   A I A C P T N L T C R P D S L G T A K P G H T R L G E H E T G C H C A G   :   4 8 7
P H O Q _ E C O L I   4 7 7   :   G R Q H S A P K D E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :   4 8 6
P R R B _ M Y C B O   4 4 3   :   P G P S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :   4 4 6
S A S A _ P R O M A   3 6 4   :   P V W D K R N K S L E P L T L T Q G - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :   3 8 1
C S S S _ B A C S U   4 5 1   :   K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -   :   4 5 1
                                                                                                                     
Красным цветом отмечены колонки со 100% идентичностью,желтым - не менее 80%

Консервативные аминокислотные остатки белка PHOQ_ECOLI

По результатам множественного выравнивания белка PHOQ_ECOLI с его потенциальными гомологами был составлен скрипт, определяющий консервативные (на 100% и более чем на 80%) аминокислоты исследуемого белка. Изучено положение этих аминокислот в белке.
На данном рисунке белок представлен в остовной модели, лиганд (ANP) в шариковой. Аминокислоты, консервативные на 100%, разукрашены в красный цвет, консервативные не менее, чем на 80% - в желтый
На рисунке изображен лиганд и окружающие его в радиусе 5Å аминокислоты. Вокруг лиганда сосредоточено 90% всех консервативных аминокислот белка, при этом количество консервативных аминокислот во всем белке составляет всего 4%. Все это говорит о том, что они играют важную роль во взаимодействии с лигандом, так как потенциально могут взаимодействовать с ним.

© Низамутдинов Игорь, 2004