Выравнивание блока создано с помощью программы GeneDoc.
Цветом отображена степень консервативности колонок в соответствии с 4 уровнями консервативности:
|
|
Пара аминокислот | nαβ | pαβ | qα | qβ | sαβ |
H,H | 109230 | 7,87*10-4 | 0,0168 | 0,0168 | 2,945 |
H,K | 437522 | 0,0032 | 0,01684 | 0,045 | 2,142 |
H,A | 245847 | 0,00177 | 0,01684 | 0,048 | 0,26 |
Условные обозначения: N общее число пар; nαβ общее количество пар в выравнивании; pαβ частота пары; qα частота аминокислоты α в паре; qβ частота аминокислоты β в паре; sαβ вес аминокислотной замены. |
Формулы для вычисления весов замен:
|
Пара аминокислот | nαβ | pαβ | qα | qβ | sαβ |
H,H | 910782 | 0,004 | 0,023 | 0,023 | 5,8897 |
H,K | 455813 | 0,002 | 0,023 | 0,051 | -0,44 |
H,A | 749007 | 0,0033 | 0,023 | 0,085 | -0,47 |
Пара аминокислот | Блок IPB003661B | 200 блоков | BLOSUM62 |
H,H | 2,945 | 5,89 | 8 |
H,K | 2,14 | -0,44 | -1 |
H,A | 0,26 | -0,47 | -2 |
© Низамутдинов Игорь, 2004