Состав записи 1O8B банка PDB

Компоненты структуры, описанной в документе PDB 1O8B

Заголовок структуры: ISOMERASE 26-NOV-02 1O8B

Название структуры: STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI RIBOSE-5-PHOSPHATE ISOMERASE, RPIA, COMPLEXED WITH ARABINOSE-5-PHOSPHATE.

В документе представлены следующие цепи макромолекул:

Идентификатор цепи	Число остатков	Название молекулы	Комментарии
A	168	RIBOSE-5-PHOSPHATE ISOMERASE	есть только остатки: 23-31,47-55,68-97,99-218; всего в белке 219 а.о.
B	212	RIBOSE-5-PHOSPHATE ISOMERASE	есть только остатки: 2-17,22-97,99-218; всего в белке 219 а.о.

В документе представлены следующие низкомолекулярные вещества:

ID	Название	Формула	Число копий	Комментарии
MSE	SELENOMETHIONINE	C5 H11 N1 O2 SE1	11	5 в цепи A и 6 в цепи B
ABF	BETA-D-ARABINOFURANOSE-5'-PHOSPHATE	C5 H11 O8 P1	2	цепи E и F
HOH	water	H2 O1	159	цепь Z

изображение цепи B

изображение цепи B в остовной модели - желтый цвет. Кроме белка изображен лиганд.

характеристика вторичной структуры цепи B

Альфа спирали (всего 7):
2-17, 29-41, 54-63, 69-73, 100-109, 139-150, 179-188.
Бета листы (3):
A состоит из тяжей(7)
66-68, 48-52, 23-26, 76-81, 112-116, 205-210, 212-217.
B состоит из тяжей(3+1)
121-123, 85-86(цепь А), 90-93, 196-198.
С состоит из тяжей(4)
153-156, 167-172, 131-135, 192-195.
изображение вторичной структуры:

Белок относится к белкам, имеющим альфа-спирали и бета-листы.