С помощью логических функций Excel было найдено несколько фрагментов последовательности, в которых все аминокислотные остатки имеют торзионные углы, изменяющиеся в следующих пределах:
-150<фи<-90 120<пси<180.

Эти фрагменты белковой цепи имеют вид прямолинейных "отрезков" и называются бета-тяжами. Несколько бета-тяжей, расположившихся в одной плоскости параллельно друг другу, образуют бета-лист (или бета-слой, что то же самое) за счет образования водородных связей между атомами их основных цепей.

В белке RlpY E.coli 8 бета-тяжей, собранных в 2 бета-листа. Бета-листы лежат в двух параллельных плосостях, причем если наложить эти плоскости одна на другую, то бета-тяжи из разных слоев окажутся взаимоперпендикулярными.

В белке присутствуют как параллельные, так антипараллельные бета-тяжи.



Также было найдено несколько фрагментов последовательности, аминокислотные остатки которых имеют торзионные углы из другой области карты Рамачандрана:
-75<фи<-45 и -60<пси<-15.

Они имеют вид спиралей, закрученных по часовой стрелке. На каждых их виток приходится по 3.6 аминокислотных остатка. Эти спирали называются альфа-спиралями и формируются за счет того, что каждая --СО-группа образует водородную связь с --NH-группой четвертого по ходу цепи остатка.

В данном белке представлены три альфа-спирали. Две из них совершают по 2.5 витка, третья - 1.5.