На главную страницу

Особенности аминокислотного состава белка SODM_bacsu

1. Последовательность белка SODM_bacsu в формате FASTA

>sp SODM_bacsu
MAYELPELPYAYDALEPHIDKETMTIHHTKHHNTYVT
NLNKAVEGNTALANKSVEELVADLDSVPENIRTAVRN
NGGGHANHKLFWTLLSPNGGGEPTGALAEEINSVFGS
FDKFKEQFAAAAAGRFGSGWAWLVVNNGKLEITSTPN
QDSPLSEGKTPILGLDVWEHAYYLNYQNRRPDYISAF
WNVVNWDEVARLYSEAK

2. Длина последовательности - 202 а.о.

3. Молекулярная масса белка - 22455 а.е.м.

Подробнее см. книгу SODM_bacsu, лист aa_mass

4. Аминокислотный состав белка SODM_Bacsu

Аминокислоты	Частота
A	0,10
C	0,00
D	0,04
E	0,08
F	0,03
G	0,07
H	0,04
I	0,03
K	0,05
L	0,09
M	0,01
N	0,09
P	0,05
Q	0,01
R	0,03
S	0,05
T	0,06
V	0,06
W	0,03
Y	0,04

Самый частый аминокислотный остаток - аланин. Самый редкий - цистеин.
Вычисления можно посмотреть на листе aa_frequences книги SODM_bacsu

5. Средний электрический заряд молекулы равен -6e

Книга SODM_bacsu, лист charge.

6. Cравнение со средним аминокислотным составом белков Bacillus Subtilis и аминокислотным составом мембранных белков данной бактерии.

На каждой диаграмме 1 - доля явно гидрофобных аминокислот, 2 - явно гидрофильных, 3 - всех остальных.
Мой белок, скорее всего, не принадлежит к мембранным.