Задание 1. Сравнение поисковых систем MRS, SRS и поисковой машины UniProt.
Надо сказать, что форматы записей SRS и MRS весьма схожи, являясь более близкими к формату текстовой записи, чем UniProt. Но лично для меня дизайн MRS удобнее из-за его лаконичности, отсутствия цветовых нагромаждений, таких как в SRS. В SRS наблюдается увеличение новых возможностей (можно запросить последовательность белка в разных форматах, есть ссылки на статьи и даже указания на их формат и возможный доступ), добавление информации (поля Protein Existence и Keywords - в MRS их нет). Следует отметить, что наиболее удобен для пользователей UniProt, т.к. информация здесь предоставляется более расширено и вследствие понятнее. В SRS и UniProt поле "Особенности" состоит не только из таблицы, но и из ее наглядного отображения, причем в SRS рисунок, иллюстрирующий расположение разных фрагментов общий, а для UniProt отдельный для каждого фрагмента.
Задание 2. Поисковая система SRS. Раздел Taxonomy.
1. Названия таксонов, которые начинаются на "gam":
- gambusia
- gammaherpesvirinae
- gammapapillomavirus
- gammaproteobacteria
- gammaretrovirus
- gammaridea
2. Английский эквивалент таксона "гамма-протеобактерии" - gammaproteobacteria
3. В банке SwissProt находится 83513 записей, описывающих белки из гамма-протеобактерий.
Задание 3.

Формулировка функции белка	Строка запроса	Количество найденных документов
L-aspartate oxidase	([swissprot-Taxonomy:gammaproteobacteria*] & ([swissprot-Description:L-aspartate*] & [swissprot-Description:oxidase*]))	9
Quinolinate synthetase B	([swissprot-Taxonomy:gammaproteobacteria*] & (([swissprot-Description:Quinolinate*] & [swissprot-Description:synthetase*]) & [swissprot-Description:B]))	9

Задание 4. .
Последовательности белков в формате fasta, найденных по запросу ([swissprot-Taxonomy:gammaproteobacteria*] & ([swissprot-Description:L-aspartate*] & [swissprot-Description:oxidase*])) можно увидеть здесь

Задание 5.
1. По запросу (([medline-AllText:L-aspartate*] & [medline-AllText:oxidase*]) & [medline-Year#2007:2009]) в быъанке Medline было найдено 5 статей с упоминанием белка L-aspartate oxidase за 2007-2009гг.
2. По запросу ([medline-Authors:Ne*fa**,a.a*] & [medline-Year#1970:1979]) было найдено 27 статей, одним из авторов которых был А.А.Нейфах. Нейфах интересовался такими вопросами как, миграция недавно синтезированной РНК во время митоза, ее перераспределение между ядром и цитоплазмой во время эмбрионального развития; изменения в сухом весе ядер в ранних эмбрионах гольца; время действия генов, контролирующих активность алдолазы в эмбриональном развитии гольцов и т.д.