Мотивы в белке DEOC_ECOLI, описанные в БД Prosite.

Результаты поиска мотивов в белке DEOC_ECOLI (по данным БД PROSITE)

Идентификатор документа PROSITE (AC)	Название мотива	Краткое описание мотива	Тип подписи (паттерн, профиль)	Паттерн (регулярное выражение)	Специфична ли подпись?	Сколько мотивов нашлось в белке?
PS00005	PKC_PHOSPHO_SITE	Protein kinase C phosphorylation site (сайт фосфорилирования протеин киназой C)	паттерн	[ST]-x-[RK]	неспецифична	5
PS00006	CK2_PHOSPHO_SITE	Casein kinase II phosphorylation site (сайт фосфорилирования казеин киназой 2)	паттерн	[ST]-x(2)-[DE]	неспецифична	3
PS00008	MYRISTYL	N-myristoylation site (сайт N-миристоилирования)	паттерн	`G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P}`	неспецифична	5
PS00004	CAMP_PHOSPHO_SITE	cAMP- and cGMP-dependent protein kinase phosphorylation site (сайт фосфорилирования цАМФ- и цГМФ-зависимой протеин киназой)	паттерн	[RK](2)-x-[ST]	неспецифична	1
PS00007	TYR_PHOSPHO_SITE	Tyrosine kinase phosphorylation site (сайт фосфорилирования тирозин киназой)	паттерн	[RK]-x(2)-[DE]-x(3)-Y or [RK]-x(3)-[DE]-x(2)-Y	неспецифична	1

Комментарий к таблице

В последовательности белка DEOC_ECOLI был проведен поиск мотивов, описанных в PROSITE, в том числе неспецифичных (часто встречающихся). По результатам поиска была составлена вышележащая таблица. Поиск проводился так: открыть главную страничку PROSITE, ввести в нужное окошко AC белка DEOC_ECOLI, нажать кнопку "Quick Scan" при выключенном чекбоксе "Exclude patterns with a high probability of occurrence" (если в нем стоит галочка, то будут выданы только "специфичные" мотивы - те, которые отвечают семействам белков, в противном случае будут выданы также "неспецифичные", часто встречающиеся мотивы).
В последовательности моего белка были найдены только неспецефические мотивы, отвечающие тем участкам в белке, которые модифицируются или могли бы модифицироваться другими белками. Вероятно это связано с тем, что сайты, ответственные за осуществление регуляции активности фермента, более консервативны или просты, чем участки из активного центра (одни и те же регуляторные белки регулируют разные другие белки; регуляторные белки => и "регуляторные" сайты более схожи между собой чем активные центры различных ферментов).