Pacшифровка кода EC 1.2.4.2

Класс 1 - оксидоредуктазы.(Oxidoreductases)


To catalyze oxidation/reduction reactions; transfer of H and O atoms or electrons from one substance to another.

Катализирует окислительно-восстановительные реакции. Переносит атомы водорода и кислорода с одного субстрата на другой.

Подкласс 2 - Acting on the aldehyde or oxo group of donors.

Взаимодействует с альдегидными или оксо- группами доноров.

Подподкласс 4 - With a disulfide as acceptor.

Акцептором является дисульфид.

Порядковый номер 1 - pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)

Пируват дегидрогеназа (переносчик ацетогруппы).

Идентификатор GO: GO:0004739

Данный фермент атализирует реакцию Pyruvate + [dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase] lipoyllysine <=>
<=> [dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase] S-acetyldihydrolipoyllysine + CO(2)
Кофактором является триаминдифосфат.

  1. Сравнение последовательностей ферментов с одинаковым кодом из эволюционно далеких организмов

    2. После запроса ((([libs={uniprot swissprot}-ID:*_ECOLI*] | [libs={uniprot swissprot}-ID:*_HUMAN*]) | [libs={uniprot swissprot}-ID:*_METPP*]) & [libs-ECNumber:1.2.4.1*])

    было найдено 2,8 и 4 фермента в организмах Escherichia coli (strain K12),Homo Sapiens и Methylibium petroleiphilum (strain PM1).
    соответственно. Последний был выбран из-за отсутствия нужного фермента у у Methanococcus jannaschii. Результаты исследования 3 ферментов:

        Фермент 1 (Escherichia coli,P0AFG8,) Фермент 2 (Homo Sapiens,P11177) Фермент 3 (Methylibium petroleiphilum (strain PM1, A2SG74)
      Идентификатор, название домена Pfam Положение в последовательности Положение в последовательности Положение в последовательности
    Домен 1 Transketolase_N (PF00456) 363-396 нет нет
    Домен 2 Transket_pyr (PF02779) нет 31-208 3-189
    Домен 3 Transketolase_C (PF02780) нет 226-349 203-325
    В результате сравнения полных последовательностей и доменов данных фериентов, было обнаружено,что последовательности архей и человека вероятно гомологичны,так как высокая степень сходства наблюдается и у доменов и у полных последовательностей. В то же время среди Ecoli не было обнаружено подобных доменов,а найденные ферменты негомологичны. Это может являться еще одним фактом,косвенно подтверждающим предположение о происхождении эукариот именно из архей.