Информация о белке LOLA_ECOLI из банка UniProt

Поле Метка поля Содержание
Код(ы) доступа ("Accession number") AC P61316; P39178; Q8X5H8
Идентификатор записи в БД ID LOLA_ECOLI
Название (краткое описание) белка DE RecName: Outer-membrane lipoprotein carrier protein; AltName:P20
Дата создания документа DT 10-MAY-2004, integrated into UniProtKB/Swiss-Prot. 10-MAY-2004, sequence version 1
Дата последнего исправления аннотации DT 16-DEC-2008, entry version 61
Число публикаций, использованных при создании документа RN 12
Журнал и год самой поздней публикации RL Журнал: EMBO J. том:22, страницы: 3199-3209(2003г.)
Ключевые слова KW 3D-структура; белок-Шаперон; Полный протеом; Прямая последовательность секвенирования; Периплазм; Транспорт белков; Сигнал; Транспорт.
Что содержит поле комментариев? СС Функция: Перенос липопротеинов из внутренней мембраны на внешнюю. Образует комплексы с липопротеинами только, если после N-концевого остатка цистеина стоит не аспартат

(Аспарагиновая кислота действует как нацеленный сигнал для того, чтобы липопротеин должен оставаться во внутренней мембране); способность внутренней мембраны удерживать сигнальную функцию на стадии выброса.

Функция: может действовать как регулятор сигнального пути трансдукции RCS-фосфорилирования.

Связь с другими источниками: P69776:lpp; NbExp=1; IntAct=EBI-553532, EBI-909750

Субклеточное расположение: периплазм;

Аналогия: принадлежит к семейству белков LOLA
Идентификаторы записей PDB DR 1IWL; 1UA8; 2ZPC; 2ZPD


1. Белок-переносчик липопротеинов находится во внешней мембране. Мутация, приводящая к потере способности связываться с липопротеинами, происходит в 68 остатке, при этом остаток фенилаланина(PHE) заменяется на остаток глутаминовой кислоты(GLU);
2. Сигнальный пептид находится с 1 по 21 аминокислотный остаток. Функция сигнального пептида заключается в том, что он направляет пост-трансляционный транспорт белка в место его фукционирования (после доставки может редуцироваться).



Запрос Число записей в SwissProt Число записей в TrEMBL
Outer-membrane lipoprotein carrier protein 144 500
3D-structure; Chaperone; Complete proteome; Direct protein sequencing; Periplasm; Protein transport; Signal; Transport. 2 0



Поле Метка поля LOLA_ECOLI LOLA_YERPE
Первый код доступа AC P61316; P39178; Q8X5H8 Q8ZGC6; Q0WH38
Идентификатор последовательности в БД ID LOLA_ECOLI LOLA_YERPE
Название (краткое описание) белка Outer-membrane lipoprotein carrier protein; AltName: P20 Outer-membrane lipoprotein carrier protein Outer-membrane lipoprotein carrier protein
Дата создания документа DT 10-MAY-2004, integrated into UniProtKB/Swiss-Prot. 10-MAY-2004, sequence version 1. 11-JUL-2002, integrated into UniProtKB/Swiss-Prot.
Дата последнего исправления аннотации DT 16-DEC-2008, entry version 61 25-NOV-2008, entry version 53
Название организма OS Escherichia coli (strain K12) Yersinia pestis
Классификация организма (список таксонов) OC Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia. Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Yersinia.
Длина последовательности FT 203 202
Молекулярная масса белка FT 22497 22242
Число публикаций, использованных при создании документа RN 12 2
Журнал и год самой поздней публикации RL Журнал: EMBO J. том:22, страницы: 3199-3209(2003г.) Журнал: DNA Res.том:11 страницы: 179-197(2004г.)
Описание вторичной структуры FT 6 альфа-спиралей: 23-30;92-94;102-104;110-116;119-122;185-188; 12 бета-тяжей: 35-46; 54-63; 67-72; 74-76; 78-91; 96-101; 125-130; 133-142; 144-152; 158-165; 170-181;1 97-200; повороты: 64-66 (остатки) _______________________
Ключевые слова KW 3D-структура; белок-Шаперон; Полный протеом; Прямая последовательность секвенирования; Периплазм; Транспорт белков; Сигнал; Транспорт Белок-Шаперон; Полный протеом;Периплазм; Транспорт белков; Сигнал; Транспорт.
Темы, освещённые в комментариях CC Функция: Перенос липопротеинов из внутренней мембраны на внешнюю. Образует комплексы с липопротеинами только, если после N-концевого остатка цистеина стоит не аспартат

(Аспарагиновая кислота действует как нацеленный сигнал для того, чтобы липопротеин должен оставаться во внутренней мембране); способность внутренней мембраны удерживать сигнальную функцию на стадии выброса.

Функция: может действовать как регулятор сигнального пути трансдукции RCS-фосфорилирования.

Связь с другими источниками: P69776:lpp; NbExp=1; IntAct=EBI-553532, EBI-909750

Субклеточное расположение: периплазм;

Аналогия: принадлежит к семейству белков LOLA		 Функция: Перенос липопротеинов из внутренней мембраны на внешнюю. Образует комплексы с липопротеинами только, если после N-концевого остатка цистеина стоит не аспартат ( Аспарагиновая кислота действует как нацеленный сигнал для того, чтобы липопротеин должен оставаться во внутренней мембране); способность внутренней мембраны удерживать сигнальную функцию на стадии выброса.
Особенности последовательности FT Белок внешней мембраны, переносчик липопротеинов. Цепь из 203 аминокислотных остатков. Сигнальную функцию выполняют первые 21 аминокислотных остатков.

При мутациях: 64 а/к остатка из аргинина в лейцин – потеря способности переноса липопротеинов в белок lolA; 68 из фенилаланина в глутаминовую кислоту приводит к потере способности связывать липопротеины		 Белок внешней мембраны, переносчик липопротеинов. Цепь из 202 аминокислотных остатков.

Сигнальную функцию выполняют первые 21 аминокислотных остатков.
Идентификаторы записей PDB DR 1IWL; 1UA8; 2ZPC; 2ZPD _________________________



Белки очень похожи: имеют примерно равную атомную массу, почти одинаковое количество остатков в цепи, но их последовательности отличаются, за исключением некоторых участков, которые практически совпадают. Это объясняет общность их функции. Можно также заметить то, что эти белки были соответственно обнаружены у Yersinia pestis и у Escherichia coli. Это бактериальные организмы, которые имеют разные экологические ниши, Escherichia coli является симбионтом,а Yersinia pestis - паразитом. Причем белок принадлежащий бактерии Yersinia pestis не был получен эксперементально, а был выведен из гомологии с белками семейства (LOLA).
Главная
©Мараховская Александра,2008