Молекулярное моделирование биополимеров

Знакомство с Pymol

Работа с Pymol

Cеми-эмпирические вычисления: Mopac

Abinitio вычисления для нафталина и азулена

Вычисление параметров для молекулярной механики

Вычисление точечных зарядов и VdW параметров для молекулярной механики

Изучение работы методов контроля температуры в GROMACS

Анализ результатов моделирование самосборки липидного бислоя.

Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом

Докинг низкомолекулярных лигандов в структуру белка.

Пример использования трехмерного QSAR анализа для предсказания активности низкомолекулярных соединений.

Расчёт энергии сольватации димера из двух мономеров полиэтиленгликоля методом FEP