Протокол занятия




Группы банков данных
Банк данных Группа
MedLine Literature, Bibliography and Reference Databases
UniProt Universal Protein Resource
UniRef100 UniProt Universal Protein Resource
EMBL Nucleotide sequence databases
PDB Protein structure databases

Таксон гамма-протеобактерии
Название таксона gammaproteobacteria
Количество документов в Swiss-Prot 43434

Запросы
Цель Строка запроса Количество найденных документов
Найти свой белок по AC [swissprot-AccNumber:P27302*] 1
Найти все документы, описывающие белки из таксона gammaproteobacteria, имеющие сходное с моим белком описание функции ([swissprot-Taxonomy:gammaproteobacteria*] & (([swissprot-Description:transketolase*] & [swissprot-Description:1]) | [swissprot-Description:transketolase 1*])) 7

Описание выборки
ID AC Организм Таксономия
1 TKT1_ECOLI P27302 ESCHERICHIA COLI BACTERIA
PROTEOBACTERIA
GAMMAPROTEOBACTERIA
ENTEROBACTERIALES
ENTEROBACTERIACEAE
ESCHERICHIA
2 TKT1_PASMU P57927 PASTEURELLA MULTOCIDA BACTERIA
PROTEOBACTERIA
GAMMAPROTEOBACTERIA
PASTEURELLALES
PASTEURELLACEAE
PASTEURELLA
3 TKT1_VIBCH Q9KUP2 VIBRIO CHOLERAE BACTERIA
PROTEOBACTERIA
GAMMAPROTEOBACTERIA
VIBRIONALES
VIBRIONACEAE
VIBRIO
4 TKT1_VIBF1 Q5E7R1 VIBRIO FISCHERI STRAIN ATCC 700601 / ES114 BACTERIA
PROTEOBACTERIA
GAMMAPROTEOBACTERIA
VIBRIONALES
VIBRIONACEAE
VIBRIO
5 TKT1_VIBPA Q87LK8 VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS BACTERIA
PROTEOBACTERIA
GAMMAPROTEOBACTERIA
VIBRIONALES
VIBRIONACEAE
VIBRIO
6 TKT1_VIBVU Q8DCA2 VIBRIO VULNIFICUS BACTERIA
PROTEOBACTERIA
GAMMAPROTEOBACTERIA
VIBRIONALES
VIBRIONACEAE
VIBRIO
7 TKT1_VIBVY Q7MHK7 VIBRIO VULNIFICUS STRAIN YJ016 BACTERIA
PROTEOBACTERIA
GAMMAPROTEOBACTERIA
VIBRIONALES
VIBRIONACEAE
VIBRIO

Вернуться на страничку второго семестра

© Головкина Мария Сергеевна