Исследование аминокислотного белка ARSC_Bacsu с помощью программы MS Excel

Исследование аминокислотного белка ARSC_Bacsu с помощью программы MS Excel
  1. Последовательность белка ARSC_Bacsu в формате FASTA
    2. >sp MENKIIYFLCTGNSCRSQMAEGWAKQYLGDEWKVYSAGIEAHGLNPNAVKAMKEVGIDISNQTSDIIDSDILNNADLVVTLCGDAADKCPMTPPHVKREHWGFDDPARAQGTEEEKWAFFQRVRDEIGNRLKEFAETGK
  2. Длина последовательности - 139 а.о.
    3. подробнее см. книгу Credit.xls лист protein_seq_input
  3. Молекулярная масса белка ARSC_Bacsu - 15586 а.е.м.
    4. подробнее см. книгу Credit.xls лист MW
  4. Аминокислотный состав белка ARSC_Bacsu
    5. Наиболее часто встречаются A, D, E, G и K
    Наиболее редко встречаются H и Y
    подробнее см. книгу Credit.xls лист aa_table
  5. Средний электрический заряд молекулы - -5,5e

    6. Метод вычисления - сумма зарядов всех аминокислот белка. подробнее см. книгу Credit.xls лист Charge
  6. Сравнение со средним аминокислотным составом белков Bacillus subtilis, а так же с аминокислотным составом мембранных белков этой же бактерии

    7. 1 - гидрофобные аминокислоты
    2 - гидрофильные аминокислоты
    3 - все остальные
    Вывод: белок ARSC_Bacsu скорее всего немембранный, потому что содержание в нем гидрофобных и гидрофильных а.о. похоже на таковое в протеоме. подробнее см. книгу Credit.xls лист HPhop_comparison
  7. Профиль гидрофобности белка ARSC_Bacsu


    8. В белке имеется явно гидрофобный участок - с 61 по 80 а.о.(примерно). подробнее см. книгу Credit.xls лист HPhob_profile