Вычисление точечных зарядов и VdW параметров для молекулярной механики
Файл p2n с координатами и зарядами атомов.
et.top - файл топологии.
|
Жидкость |
|
Газ |
|
| Epsilon |
LJ(kJ/mol) |
Coulomb(kJ/mol) |
LJ(kJ/mol) |
Coulomb(kJ/mol) |
| 1.00000 |
-241.252 |
0.104627 |
-0.000226489 |
0.00563674 |
| 0.12500 |
-33.4987 |
0.03734 |
-0.000157829 |
0.00563675 |
| 0.03703 |
-2.17679 |
0.0167636 |
-0.000141172 |
0.00563674 |
| 0.01562 |
-2.28293 |
0.0148439 |
-0.000134252 |
0.00563673 |
| 0.00800 |
-2.52502 |
0.0145191 |
-0.000130619 |
0.00563673 |
| 0.00462 |
-2.73929 |
0.0144559 |
-0.000128428 |
0.00563673 |
| 0.00291 |
-1.07137 |
0.0141016 |
-0.000126999 |
0.00563673 |
Для газа значения энергий VdW взаимодействий имеют порядок 10-4, а у жидкости минимальный порядок 1.
Кулоновские взаимодействия для обеих фаз меньше, чем VdW.
Рассмотрим энтальпии испарения для VdW взаимодействий в жидкой фазе, энтальпия испарения этана при Т=25 равна 5.4 кДж/мол.
Эпсилон водорода должна лежать в диапозоне от 0.01562 до 0.03703.
© Свистунова Даша