Программы пакета BLAST для работы с нуклеотидными последовательностями

Поиск гомологов белка OBG_BACSU в геноме Streptococcus agalactiae

Число находок с E-value < 0,001	4
E-value лучшей находки	1e-154
Название последовательности с лучшей находкой	embl\|AL766851\|AL766851 Streptococcus agalactiae NEM316 complete genome, segment 9
Координаты лучшей находки (от-до)	90639-89335
Процент последовательности белка, вошедший в выравнивание с лучшей находкой	100%

Нахождение записи EMBL по последовательности программой BLASTN

а) Запись содержится в последовательности EM_PRO:AB001291.
б) Координаты последовательности в записи 654-833. Последовательность соответствует записи.
в) Последовательность совпала с участком гена uvrD 1..2255, и сонаправлена с ним.

Поиск гомологов гена программой BLASTN

Используя файл с последовательностью гена OBG_BACSU были получены следующие результаты:
Была найдена последовательность embl|AL766851|AL766851 с Expect = 1e-74. Координаты выравнивания 90639-89744.
При выравнивании белка было найдено 4 находки. E-value выравнивания с белком меньше. Однако выравнивание нуклеиновых кислот короче.