Пакет EMBOSS.

    Матрица BLOSUM62.

    Результаты "ручного" подсчета веса выравнивания.

    stretcher

    Результаты ручного подсчета и программы не совпали.Новый результат 43. Ссылка на файл выравнивания.

    needle, water

    Ссылки на файлы needle, water.
  1. Участки вошедшие в частичное выравнивание: OBG_BACSU 2-328; OBG_GEOMG 3-330.
  2. Локальное выравнивание с "ограничением" глобального на эти участки полностью совпало. Также имеется дополнительный выровненный участок.
  3. Вес локального выравнивания - 977.5, глобального - 973. Вес глобального не сможет быть больше, так как с увеличением количества аминокислотных остатков снижает вероятность совпадения и увеличивает количество гэпов.

    dotmatcher

    © Nikolay Kondratev