На главную страницу первого семестра Ligand

Изображение области связывания ионов цинка с цепью А.

Красные шаровидные атомы - ионы цинка. АА1 - аминокислотные остатки Asp293, Asp352, непосредственно связывают ионы цинка. АА2 - аминокислотный остаток Lys270, находится в непосредственной близости. Красный остов - цепь А.
Данная область была определенна вручную. Выделив атомы цинка и цепь А, увеличила область и выделила соответсвующие аминокислотные остаткию Подписала элементы.

Проект генно-инженерного эксперимента

- С 2 ионами цинка из цепи А контактируют следующие аминокислотные остатки: Asp293, Glu354, Lys270, Asp352, Asp275, Leu272, Cys323, Phe274. С одним цинком связываются через атом кислорода следующие аминокислоты: Asp352, Phe274, Asp275, Glu354. C другим, таким же образом: Glu354, Cys323 , Asp293, Leu272. Lys270 находится в непосредственной близости от ионов цинка, возможно его влияние на них.
- В аминокислотном остатке Asp 293 и Asp352 имеется группа СОО- , за счет которой и происходит присоединение иона цинка. Если этот аминокислотный остаток заменить на другой, без карбоксильной группы, то он соответственно не сможет выполнять эту функцию. Примером такого аминокислотного остатка может служить аланин.
- Довольно близко от ионов цинка располагается Lys 270 и предположительно с ним контактирует. Возможно, замена лизина на аргинин мало отобразиться на функциях белка и функции ионов цинков в частности, поскольку он также относится к положительно заряженным аминокислотам и несет на конце NH2 группу.


©Попенко Анна