На главную страницу первого семестра AMPA_ECOLI

Цитоплазматическая пептидаза (Cytosole peptidase)

Краткое название белка...................AMPA_ECOLI
Полное название организма................Escherichia coli, K-12
Название гена............................pepA
Номер локуса в бактериальной хромосоме...b4260
Последовательность в формате FASTA:
>AMPA_ECOLI Cytosole peptidase
MEFSVKSGSPEKQRSACIVVGVFEPRRLSPIAEQLDKISDGYIS
ALLRRGELEGKPGQTLLLHHVPNVLSERILLIGCGKERELDERQYKQVIQKTINTLND
TGSMEAVCFLTELHVKGRNNYWKVRQAVETAKETLYSFDQLKTNKSEPRRPLRKMVFN
VPTRRELTSGERAIQHGLAIAAGIKAAKDLGNMPPNICNAAYLASQARQLADSYSKNV
ITRVIGEQQMKELGMHSYLAVGQGSQNESLMSVIEYKGNASEDARPIVLVGKGLTFDS
GGISIKPSEGMDEMKYDMCGAAAVYGVMRMVAELQLPINVIGVLAGCENMPGGRAYRP
GDVLTTMSGQTVEVLNTDAEGRLVLCDVLTYVERFEPEAVIDVATLTGACVIALGHHI
TGLMANHNPLAHELIAASEQSGDRAWRLPLGDEYQEQLESNFADMANIGGRPGGAITA
GCFLSRFTRKYNWAHLDIAGTAWRSGKAKGATGRPVALLAQFLLNRAGFNGEE
Аминокислотный состав <*TD>
                    
A(Аланин)          	9,5%
C(Цистеин)	        1,8%
D(Аспарагиновая кислота)3,8%
E(Глутаминовая кислота)	7,5%
F(Фенилаланин)	        2,4%
G(Глицин)	        9,8%
H(Гистидин)	        2,0%
I(Изолейцин)	        5,2%
K(Лизин)	        4,8%
L(Лейцин)	       10,0%
M(Метионин)	        3,2%
N(Аспарагин)	        4,6%
P(Пролин)	        4,0%
Q(Глутамин)	        4,1%
R(Аргинин)	        6,4%
S(Серин)	        5,85
T(Треонин)	        5,0%
V(Валин)	        6,6%
W(Триптофан)	        0,8%
Y(Тирозин)	        2,8%
  • Длина последовательности: 503 a.o.
  • Молярная масса: 54887,33 г/моль
  • Средний заряд молекулы:

    при pH=7,0: +0,011 единичных электронных зарядов

    при pH=1,0: +65,95 единичных электронных зарядов

  • Отношение гидрофобных остатков к гидрофильным.
 Объект     Отношение
 E. сoli    1,07
 TC 2A      7,37
 AMPA ECOLI 1
Согласно этим наблюдениям, протеом E. сoli состоит по большей части из гидрофобных белков, т.к. отношение ,больше единицы. Тоже самое можно сказать и о классе мембранных белков ТС 2А но в гораздо большей степени. Отношение гидрофобных аминокислот к гидрофильным в белке AMPA ECOLI составляет 1 что означает, что число их равно, белок по сути своей нейтрален в этом отношении. AMPA_ECOli ближе к протеому E.coli, нежели чем к мембранным белкам ТС 2А, следовательно таковым и не является.


©Попенко Анна