b)В банке EMBL была найдена информация о списке слассов с их обозначением
и описанием:
а также число записей каждого класса:
При просмотре найденной информации было обнаружено, что не проиндексированы
записи классов ANN, CON, GRV, MGA, SET, WGS.
c)В банке EMBL представлены следующие разделы:
d)
Основываясь на полученных данных можно сделать вывод, что в разделах ENV и HUM наблюдается
положительная динамика роста, что, вероятно, связано с
интенсивными исследованиями в этих областях.
В разделе MUS за тот же период произошло резкое снижение данамики поступления данных.
2.В записи EMBL с кодом доступа BA000025 было найдено описание гена MICA.
Получена следующая информация:
Направление гена относительно направления, выбранного для записи: обратное
Число кодирующих участков: 5
Длина первого кодирующего участка: 70
Длина последнего кодирующего участка: 107
Длина первого интрона: 6840
Длина последнего интрона: 99
3.При помощи программы seqret с опцией -sask был вырезан самый длинный кодирующий
участок гена MICA 428831..429132 в отдельный файл.
На странице http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/ программе blastx
в поле upload file был подан файл в fasta-формате с вырезанной ранее
последовательностью.
В поле database был выбран банк swissprot, после чего
был запущен поиск. В результате нашёлся 1 белок Q29983.1(MICA_HUMAN).
Участок этого белка c 299 по 317 аминокислотный остаток соответствует введённой последовательности.
4.
Идентификатор записи EMBL | Тип молекулы | Класс данных | Раздел EMBL | Дата создания документа |
Описание | Длина последовательности |
X01818 | genomic DNA | STD | PRO | 28-JAN-1986 | E. coli trmD operon and nearby regions | 4586 |
AP009048 | genomic DNA | STD | PRO | 22-JAN-2006 | Escherichia coli W3110 DNA, complete genome | 4646332 |
U00096 | genomic DNA | STD | PRO | 23-FEB-2006 | Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655, complete genome | 4639675 |