Занятие 3.PubMed


  1. Для того, чтобы найти количество статей, включающих название моего белка, в строке поиска в PubMed я ввела в поле "All Fields" название своего белка

  2. Результаты сохранены в файле query1.txt.

  3. Из списка найденных статей я выбрала статью под названием "Human RECQ1 is a DNA damage responsive protein required for genotoxic stress resistance and suppression of sister chromatid exchanges." Аннотация на эту статью сохранена в файле abstract.txt. После того как я нашла автора данной публикации, это Brosh RM Jr, ввела в поле запроса ограничение публикаций данного автора за последние 3 года. В итоге получилось 20 статей. Результаты поиска сохранены в файле query2.txt.

  4. Для того, чтобы найти ссылки об опоясывающем лишае (shingles), в поле поиска я ввлела название заболевания (shingles), в результате нашлось 11196 статей. Первая страница результатов сохранена в файле query3.txt Разговорное слово "лишай" PubMed распознает как "herpes zoster".

  Дополнительные задания

  1. Найдём информацию о кровотечении из носа (nosebleed) при гипертонии (hypertension). отобразив все полученные ссылки на одной странице, сохранила их в файле query_add1.txt

  2. Найдём ссылки о генетически модифицированной еде (genetically modified food).Запрос выглядит следущим образом: "food, genetically modified"[MeSH Terms] OR ("food"[All Fields] AND "genetically"[All Fields] AND "modified"[All Fields]) OR "genetically modified food"[All Fields] OR ("genetically"[All Fields] AND "modified"[All Fields] AND "food"[All Fields]). Всего найдено 2403 статьи. Результаты поиска в виде списка аннотаций сохранены в файле query_add2.txt

  3. Надём информацию о болях зуба мудрости. Для этого в строке запроса вводим wisdom tooth and pain, в результате получается следущий запрос: ("molar, third"[MeSH Terms] OR ("molar"[All Fields] AND "third"[All Fields]) OR "third molar"[All Fields] OR ("wisdom"[All Fields] AND "tooth"[All Fields]) OR "wisdom tooth"[All Fields]) AND ("pain"[MeSH Terms] OR "pain"[All Fields]). Согласно MeSH, этот термин определяется как "molar, third" и болезнь - "pain".


  4. Найти все статьи, посвященные аневризме головного мозга за последние 2 года. Запрос в PubMed будет звучать следущим образом: ("aneurysm"[MeSH Terms] OR "aneurysm"[All Fields]) AND ("blood vessels"[MeSH Terms] OR ("blood"[All Fields] AND "vessels"[All Fields]) OR "blood vessels"[All Fields] OR "vessels"[All Fields]) AND ("brain"[MeSH Terms] OR "brain"[All Fields]) AND ("2007/03/17"[PDat] : "2009/03/15"[PDat]) Всего найдено 217 статей.