| Метка поля | Содержание | |
| Коды доступа ("Accession number") | AC | P15043; P76762; Q2M8C7; Q6BEZ3 |
| Идентификатор записи в БД | ID | RECQ_ECOLI |
| Название (краткое описание) белка | DE | АТФ зависимая ДНК геликаза-recQ |
| Дата создания документа | DT | 01 апреля 1990 |
| Дата последнего исправления аннотации | DT | 16 декабря 2008 |
| Число публикаций, использованных при создании документа | DT | 96 |
| Журнал и год самой поздней публикации (самая поздная публикация выделена жирным) | RL | Mol. Gen. Genet. 205:298-304(1986)
Science 257:771-778(1992). Science 277:1453-1474(1997). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87:5363-5367(1990). Nucleic Acids Res. 34:1-9(2006). |
| Ключевые слова | KW | 3D-структура; АТФ-связывающий; Полный протеом;
Главное определение последовательности аминокислотных остатков белка; дефект ДНК; рекомбинация ДНК; репарация ДНК; ДНК-связывающий; Геликаза; Гидролаза; Нуклотид-связывающий; SOS репарация. |
| Комментарии | CC | функции: участвует в одном из факторов рекомбинации - recF.
Этот ген экспресси находится под регуляцией системы СОС-репарации. Белок относится к ДНК-геликазам. Сходство: принадлежит семейству Геликазы, подсемейству RECQ. Содержит 1 геликазу АТФ-связывающего домена. Содержит 1 геликазу C-терминального домена. Содержит 1 HRDC домен. |
| Идентификаторы записей PDB | DR | 1OYW, 1OYY, 1WUD |
Вопрос: "Мутация какого участка белка не позволит связаться кофактору, необходимому для работы этого белка?"
Ответ: Мутация участка от 47 до 54 нуклеотидов не позволит связаться кофактору ATP (Potential).
| Запрос | Число записей в SwissProt |
Число записей в TrEMBL |
| ATP-dependent DNA helicase recQ | 31 | 1711 |
| ATP-dependent DNA helicase | 3250 | 21980 |
| helicase recQ | 40 | 1846 |
| Метка поля | Белок 1 | Белок 2 | |
| Первый код доступа | AC | P15043 | P56255 |
| Идентификатор последовательности в БД | ID | RECQ_ECOLI | PCRA_BACST |
| Название (краткое описание) белка | DE | ATP-dependent DNA helicase recQ; EC=3.6.1.-; | ATP-dependent DNA helicase pcrA; EC=3.6.1.-; |
| Дата создания документа | DT | 01 апреля 1990 | 15 июля 1998 |
| Дата последнего исправления аннотации | DT | 16 декабря 2008 | 25 ноября 2008 |
| Название организма | OS | Escherichia coli (strain K12). | Bacillus stearothermophilus (Geobacillus stearothermophilus). |
| Классификация организма (список таксонов) | OS | Бактерии; Протеобактерии; Гаммапротеобактерии; Класс Интеробактерии; Семейство Интеробактерии; Escherichia. | Bacteria; Firmicutes; Bacillales; Bacillaceae; Geobacillus. |
| Длина последовательности | ID | 609 | 724 |
| Молекулярная масса белка | MW | 68364 | 82488 |
| Число публикаций, использованных при создании документа | DT | 96 | 52 |
| Журнал и год самой поздней публикации | RL | Mol. Syst. Biol. 2:E1-E5(2006). | Nucleic Acids Res. 27:3310-3317(1999) |
| Описание вторичной структуры | - | Может определиться RasMol, но не содержится как таковая в UniProt. | "--" |
| Ключевые слова | KW | 3D-структура; АТФ-связывающий; Полный протеом; Главное определение последовательности аминокислотных остатков белка; дефект ДНК; рекомбинация ДНК; репарация ДНК; ДНК-связывающий; Геликаза; Гидролаза; Нуклотид-связывающий; SOS репарация. | 3D-структура; АТФ-связывающий; ДНК-связывающий; Геликаза; Гидролаза; Нуклеотид-связывающий. |
| Темы, освещённые в комментариях | СС | Функции; сходство. | Функции; сходство; субчастица. |
| Особенности последовательности |
FT | INIT_MET; Цепь; Домены; Последовательсть нуклеотидов, связанных с кофактором; MOTIF; Конфликт; Спираль; Граница спирали; | Цепь: 1, 724 амин., АТФ-зависимая ДНК геликаза pcrA/FTId=PRO_0000102050.
Домен: 10, 289 амин., UvrD-подобная АТФ-связывающая геликаза. Домен: 290, 569 амин., UvrD-подобная С-терминальная геликаза. Нуклеотдиды, контактирующие с АТФ-связыващим кофактором. Спираль; Граница спирали; Поворот. |
| Идентификаторы записей PDB | DR | 1OYW; 1OYY; 1WUD | 1PJR; 1QHG; 1QHH; 2PJR; 3PJR |
Среди выбранных мной белков, чьё описание близко к описанию моего белка, нет содержащих третичную структуру. Все белки имеют вторичную структуру.