|
Факультет Биоинженерии и биоинформатики |
Описание свойств пермиазного белка систамы транспорта витамина B12
в производных базах данных.
Для описания свойств были использованы следующие базы данных:
- Prosite
- первая, в своем роде, база данных, в которой содержатся биологически значимые сайты, паттерны и профили, т.е. те
участки аминокислотных последовательностей белков, которые могут нести какую-либо биологическую функцию.Документ Prosite может быть представлен либо в виде паттерна - для сайтов - или профиля PSSM (для мотивов, выводимых из большего числа
последовательностей)
- Pfam
- база данных, в которой содержится большая коллекция множественных выравниваний, доменов, семейств и профилей-HMM для них. Она удобна для анализа доменной структуры белков.
InterPro -
эта база данных, появившаяся в 1999 году представляет собой интегрированый ресурс белковых семейств, доменов и функциональных сайтов. Она содержит все документы таких баз данных как: Prosite, Pfam, ProDom и всех подобных им.
Главная страница             
Второй семестр             
© 2004. ФББ МГУ им. М.В.Ломоносова
|