Поисковые системы MRS,SRS,UniProtS

Ссылка на Google

Ссылка на сайт kodomo

1.Поиск белка ESTA_BACSU в банке SwissProt,пользуясь системами:
  • MRS
  • SRS
  • UniProt
    Все три поисковые системы выдают достаточно подробную информацию о белке PCRB_BACSU.
    Поле References лучше всего представлено в SRS. А в целом все эти системы имеют одни и те же поля, из которых набибольшие различия встречаются в поле Features.
    В MRS в данном поле отсутсвует цветная шкала, которая наглядно показывает структуру белка, в отличие от SRS и UniProt,где она есть. Sequence annotation в UniProt более структурирована и понятна.
    2. Values in SwissProt(поле "Taxonomy" банка SwissProt)
    1)Названия каких таксонов начинаются на "gam"?
    Ответ: gambusia
    gammacoronavirus
    gammaherpesvirinae
    gammalipothrixvirus
    gammapapillomavirus
    gammaproteobacteria
    gammaretrovirus
    gammaridea
    2)Каков английский эквивалент таксона "гамма-протеобактерии"?
    Ответ:gammaproteobacteria
    3)Сколько в банке SwissProt записей, описывающих белки из гамма-протеобактерий?
    Ответ:120605
    3. Запросы к банку SwissProt
    Формулировка функции белка Строка запроса Количество найденных документов
    Probable prenyltransferase that may catalyze the transfer of a prenyl moiety to sn-glycerol-1-phosphate (G1P) gammaproteobacteria*&prenyltransferase* 342
    4.Последовательность в FASTA-формате
    5. (дополнительное задание)
    1) 5 статей, из них 2 статьи - последних 3х лет
    2) Запрос: Neyfakh,A.A 1970:1979
    Найденных статей - 11
    Интересы: Migration of newly-synthesized RNA during mitosis. IV

    © Шерстюк Александра, MSU 2009