Классификация функций. Коды ферментов.




Заданный код фермента:EC 5.3.1.1

  1. Код фермента EC 5.3.1.1, его значение.
  2. Данные получены при помощи сервера International Union of Biochemistry and Molecular Biology.
    Пункт Расшифровка Расшифровка
    EC 5 Isomerases These enzymes catalyse changes within one molecule. Катализируют изменения в одной молекуле.
    EC 5.3 Intramolecular Oxidoreductases These enzymes bring about the oxidation of one part of a molecule with a corresponding reduction of another part. Эти ферменты осуществляют окисление одной части молекулы и соответствующее уничтожение ее другой части.
    EC 5.3.1 Sugar isomerases The enzymes converting, in the sugar series, aldoses to ketoses and vice-versa Ферменты, преобразующие альдозы в кетозы и кетозы в альдозы.
    EC 5.3.1.1 Triose-phosphate isomerase (D-glyceraldehyde-3-phosphate aldose-ketose-isomerase, phosphotriose isomerase) D-glyceraldehyde-3-phosphate aldose-ketose-isomerase.D-glyceraldehyde 3-phosphate = glycerone phosphate Систематическое название - D-глицеральдегид-3-фосфат альдозо-кеотозо-изомераза. Осуществляемая реакция:D-глицеральдегид-3-фосфат = глицеронфосфат.Схема осуществляемых реакций

    Ссылки на информацию в других базах данных:BRENDA , EXPASY
  3. Сравнение последовательностей ферментов с одинаковым кодом из эволюционно далеких организмов.


  4. Выравнивание белковых последовательностей.
    Как видно из выравнивания,данные белки весьма сильно различаются по последовательности.
    Вид запроса в SRS:
    All text- EC=5.3.1.1
    EntryName - *_Human|*_Metja|*_ECOLI;
    Таблица:

        Фермент 1 (TPIS_ECOLI,P0A858) Фермент 2 (TPIS_METJA,Q58923) Фермент 3 (TPIS_HUMAN,P60174)
      Идентификатор, название домена Pfam Положение в последовательности Положение в последовательности Положение в последовательности
    Домен 1 Triosephosphate isomerase,PF00121 4-246 53-219 7-245

Вывод:хотя белки весьма сильно различаюся по последовательности,все они содержат одинаковые домены,они гомологичны.

Главная страница

Первый семестр

Второй семестр

Третий семестр

Четвертый семестр

©Александра Литвинчук,2009