Онтология GO (название словаря) | Количество ассоциированных терминов GO | Краткий ответ на вопрос | |
---|---|---|---|
Где? | cellular component | 1 | В митохондриях |
Зачем, для чего? | biological process,mRNA maturation | 2 | Любой процесс, вовлеченный в преобразование первичного транскрипта мРНК в одну или несколько зрелых молекул мРНК, готовых к трансляции. Внесение фосфатной группы в белок.. |
Молекулярный механизм? | Molecular function. Molecular functionprotamine kinase activity (протаминкиназная активность). | 5 | Катализирует гидролиз эфирных связей между рибонуклеиновыми кислотами посредством внесения внутренних разрывов в область 5'-фосфомоноэфиров. |
Специфичность? | molecular function;zinc binding | 3 | Специфически взаимодействует с АТФ, избирательно взаимодествует с РНК(portion thereof), избирательно взаимодействует с ионами цинка. |
Количество записей | Запрос | |
Всего из данного организма | 7876 | Organism name - Arabidopsis thaliana |
С идентификаторами всех трёх онтологий GO | 4528 | Organism name - Arabidopsis thaliana ,Links:DBxref - GO:&P:&F:&C: |
В том числе (укажите Вашу группу) | 14 | Organism name - Arabidopsis thaliana ,Links:DBxref - GO:&P:&F:&C:, Links:DBxref - GO:0031966 |
В том числе те, у которых встречается хотя бы один раз самое хорошее доказательство функции (коды EXP, IDA или TAS) | 3 | Organism name - Arabidopsis thaliana,Links:DBxref - Go:&P:&F:&C:&Go:&EXP:|Go:&IDA:|Go:&TAS:, Links:DBxref - GO:0031966 |
В том числе только с самыми хорошими доказательствами функции (коды только EXP, IDA или TAS) | 3 | Organism name - Arabidopsis thaliana,Links:DBxref -Go:&EXP:|Go:&IDA:|Go:&TAS: , Links:DBxref - GO:0031966 |
Таким образом, можно сделать вывод,что белки заданной группы аннотировано достаточно хорошо,так как из 14 известных белков в митохондриальной мембране данного организма 3 имеют самое хорошее доказательство функций.
©Александра Литвинчук,2009