Банк SwissProt.

Таблица 1.Cравнение белка HSLV_E.COLI и схожего белка

  Метка поля Белок HSLV_ECOLI Белок HSLV_AERS4
Первый код доступа AC P0A7B8 A4SHM2
Идентификатор последовательности в БД ID HSLV_E.COLI HSLV_AERS4
Название (краткое описание) белка DE ATP-dependent protease hslV (EC 3.4.25.-) (Heat shock protein hslV). ATP-dependent protease hslV (EC 3.4.25.-) (Heat shock protein hslV).
Дата создания документа DT 07-JUN-2005, integrated into UniProtKB/Swiss-Prot. 15-JAN-2008, integrated into UniProtKB/Swiss-Prot.
Дата последнего исправления аннотации DT 05-FEB-2008, entry version 33. 05-FEB-2008, entry version 25.
Название организма OS Escherichia coli (strain K12). Aeromonas salmonicida (strain A449).
Классификация организма (список таксонов) OC Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae; Escherichia. Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Aeromonadales;Aeromonadaceae; Aeromonas.
Длина последовательности ID or SQ 176 177
Молекулярная масса белка SQ 19093 18901
Число публикаций, использованных при создании документа RN 9 1
Журнал и год самой поздней публикации RL Mol. Syst. Biol. 2:E1-E5(2006). Submitted (MAR-2007) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases..
Описание вторичной структуры FT Описание включает описание расположения альфа-спиралей и бета-тяжей в белке. Описание включает описание расположения альфа-спиралей и бета-тяжей в белке(здесь дается ссылка на описание белка /FTId=PRO_1000012571).
Ключевые слова KW 3D-structure; Complete proteome; Cytoplasm; Hydrolase; Protease; Stress response; Threonine protease Complete proteome; Cytoplasm; Hydrolase; Protease; Threonine protease.
Темы, освещённые в комментариях СС Описание функций белка (FUNCTION), его строение (SUBUNIT), место нахождения в клетке (SUBCELLULAR LOCATION), классификацию (SIMILARITY) и особые комментарии и замечания(CAUTION). Описание функций белка (FUNCTION), его строение (SUBUNIT), место нахождения в клетке (SUBCELLULAR LOCATION), классификацию (SIMILARITY).
Особенности последовательности FT 176 аминокислот.Начало со второй аминокислоты.5 альфа-спиралей и 7 бета-тяжей 177 аминокислот.
Идентификаторы записей PDB DR
PDB; 1E94; X-ray; 2.80 A; A/B/C/D=2-176.
PDB; 1G4A; X-ray; 3.00 A; A/B/C/D=1-176.
PDB; 1G4B; X-ray; 7.00 A; M/N/O/P=1-176.
PDB; 1HQY; X-ray; 2.80 A; A/B/C/D=2-176.
PDB; 1HT1; X-ray; 2.80 A; A/B/C/D/V/X/Y/Z=1-176.
PDB; 1HT2; X-ray; 2.80 A; A/B/C/D/I/J/K/L=1-176.
PDB; 1NED; X-ray; 3.80 A; A/B/C=1-176.
PDBsum; 1E94; -.
PDBsum; 1G4A; -.
PDBsum; 1G4B; -.
PDBsum; 1HQY; -.
PDBsum; 1HT1; -.
PDBsum; 1HT2; -.
PDBsum; 1NED; -.
нет

  Различий между записями белков практически нет, основное отличие- в аминокислотном составе белков и соответственно в их молекулярной массе(в белке E.coli 176 аминокислотных остатков,а в белке AERS4 -177 соответственно) .

Главная страница

Первый семестр.

Второй семестр.


©Александра Литвинчук,2008