Карбоангидраза

Carbonic Anhydrase

Краткое название белка — CAN_ECOLI
Полное название организма — Escherichia coli, K – 12
Название гена — can (Синоним — cynT2).
Номер локуса в бактериальной хромосоме — b0126

Последовательность в формате FASTA

>CAN_ECOLI hypothetical protein in hpt-panD intergenic region

MKDIDTLISNNALWSKMLVEEDPGFFEKLAQAQKPRFLWIGCSDSRVPAERLTGLEPGELFVHRNVANLVIHTDLNCLSV VQYAVDVLEVEHIIICGHYGCGGVQAAVENPELGLINNWLLHIRDIWFKHSSLLGEMPQERRLDTLCELNVMEQVYNLGH STIMQSAWKRGQKVTIHGWAYGIHDGLLRDLDVTATNRETLEQRYRHGISNLKLKHANHK

Мои вычисления с помощью Excel

Аминокислотный состав белка

Аминокислотный остаток	Частота остатка в CAN_ECOLI
A (Аланин)	5,5%
C (Цистеин)	2,3%
D (Аспарагиновая кислота)	5%
E (Глутаминовая кислота)	7,3%
F (Фенилаланин)	2,3%
G (Глицин)	5,5%
H (Гистидин)	5,5%
I (Изолейцин)	6,4%
K (Лизин)	4,5%
L (Лейцин)	12,7%
M (Метионин)	2,3%
N (Аспарагин)	5,9%
P (Пролин)	2,7%
Q (Глутамин)	4,1%
R (Аргинин)	5,5%
S (Серин)	4,5%
T (Треонин)	4,1%
V (Валин)	7,3%
W (Триптофан)	2,7%
Y (Тирозин)	2,3%

Длина последовательности — 220 а.о.
Молярная масса — 25100,55 г/моль.
Средний заряд молекулы при рН=7.0 — -3,6.
Отношение содержания гидрофобных остатков:
   Аланин, Цистеин, Фенилаланин, Изолейцин, Лейцин, Метионин, Валин
к содержанию гидрофильных:
   Аспарагиновая кислота, Глутаминовая кислота, Гистидин,
   Аспарагин, Глутамин, Аргинин, Серин
равно 0,9, из чего можно заключить,что данный белок не является мембранным.

На главную страницу семестра