Возврат на главную страницу второго семестра

Банки данных Swiss-Prot и Uniprot

Данные банка Swiss-Prot о белке CRP_ECOLI

Описание поля

Метка поля (line code)

Значение

Внутренний уникальный постоянный идентификатор документа AC P03020
Стандартное имя последовательности (идентификатор последовательности) ID CRP_ECOLI
Название белка, отражающее его функции DE Белок-рецептор циклического аденозинмонофосфата (catabolite gene activator, cAMP receptor protein, cAMP-regulatory protein)
Дата создания документа DT 21-JUL-1986
Дата последнего исправления аннотации DT 01-FEB-2005
Название организма OS Escherichia coli, Escherichia coli O6, Escherichia coli O157:H7 и Shigella flexneri
Полное название таксона OC Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia
Длина последовательности SQ 210 а.о.
Молекулярная масса белка SQ 23640 а.е.м.
Число публикаций, использованных при создании документа RN 16
Название журнала с самой свежей публикацией RL Infect. Immun.
Описание вторичной структуры FT Здесь описывются элементы вторичной структуры с указанием номеров аминокислотных остатков их образующих, т.е. α-спиралей, β-листов, поворотов
Что содержит поле комментариев? CC В поле коментариев указана функция белка и его особенность: белок связывается с ДНК в виде димера. Указана черта сходства с другими белками того же семейства, а именно — наличие одного участка связывания ДНК, а также информация об авторских правах (т.е. то, что использование информации возможно только если в текст не вносятся изменения и сохранена данная вставка)
Какие особенности последовательности указаны? FT Указаны последствия экспериментально проведенной замены некоторых аминокислотных остатков (то, как влияет данная замена на связывание лиганда и ДНК). Указаны номера аминокислотных остатков, которые принимают участие в связывании лиганда (cAMP) и ДНК. Также указано наличие домена HTH типа crp. Наконец, имеется описание вторичной структуры, т.е. какие аминокислотные остатки составляют ее элементы
Идентификатор файла PDB DR 1CGP; 1G6N; 1HW5; 1I5Z; 1I6X; 1J59; 1LB2 1O3Q; 1O3R; 1O3S; 1O3T; 1RUN; 1RUO; 2CGP; 2GAP

Более подробную информацию о белке CRP_ECOLI можно получить в базе данных Swiss-Prot, откуда и были взяты сведения, приведенные здесь.

Результаты поиска в БД UniProt белков с тем же кратким описанием (DE), что и CRP_ECOLI

Поиск производился с помощью поисковой системы SRS. Для поиска использовалось поле Description; для вывода полученных данных выбирались поля Taxonomy и Description.

Таксон

Запрос

Количество найденных документов

Археи (Archaea) ([uniprot-Taxonomy:Archaea*] & (((([uniprot-Description:Catabolite*] & [uniprot-Description:gene*]) & [uniprot-Description:activator*]) | (([uniprot-Description:cAMP*] & [uniprot-Description:receptor*]) & [uniprot-Description:protein*])) | ([uniprot-Description:cAMP-regulatory*] & [uniprot-Description:protein*]))) 0
Бактерии (Bacteria) ([uniprot-Taxonomy:Bacteria*] & (((([uniprot-Description:Catabolite*] & [uniprot-Description:gene*]) & [uniprot-Description:activator*]) | (([uniprot-Description:cAMP*] & [uniprot-Description:receptor*]) & [uniprot-Description:protein*])) | ([uniprot-Description:cAMP-regulatory*] & [uniprot-Description:protein*]))) 26
Эукариоты (Eukaryota) ([uniprot-Taxonomy:Eukaryota*] & (((([uniprot-Description:Catabolite*] & [uniprot-Description:gene*]) & [uniprot-Description:activator*]) | (([uniprot-Description:cAMP*] & [uniprot-Description:receptor*]) & [uniprot-Description:protein*])) | ([uniprot-Description:cAMP-regulatory*] & [uniprot-Description:protein*]))) 0


© Dibrova Dasha aka UdavDasha, 2005