Банки данных Swiss-Prot и UniProt

Назад

Характеристика Метка поля (line code) Запись
Внутренний уникальный постоянный идентификатор документа AC P03002
Стандартное имя последовательности (идентификатор последовательности) ID RHO_ECOLI
Название белка, отражающее его функции DE Фактор терминации транскрипции rho
Дата создания документа DT 21 июля, 1986 года
Дата последнего исправления аннотации DT 1 мая, 2005 года
Название организма OS Escherichia coli; Escherichia coli O6; Escherichia coli O157:H7; Shigella flexneri.
Полное название таксона OC Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia.
Длина последовательности SQ 419 а.о.
Молекулярная масса белка SQ 47004 а.е.м.
Число публикаций, использованных при создании документа RN 17
Название журнала с самой свежей публикацией RL Infect. Immun. 71:2775-2786(2003)
Описание вторичной структуры FT
  • α–спирали и β–тяжи, входящие в данный белок, с номерами их начальных и конечных остатков
  • остатки "поворотов" цепи.
  • Что содержит поле комментариев? CC
  • Функция
  • Число доменов
  • Область, которую узнаёт какая-то другая молекула
  • Источник информации в поле комментариев
  • Какие особенности последовательности указаны? FT
  • Домены
  • Область связывания фосфорилированного нуклеотида
  • Известные и исследованные мутации
  • Противоречие
  • β–листы
  • α–спирали
  • Области поворотов
  • Идентификатор файла PDB DR PDB; 1A8V; X–ray; A/B=1–118.

    ресурс Swiss-Prot

    Результаты поиска в БД UniProt белков с тем же кратким описанием (DE), что и у белка RHO_ECOLI

    SRSПоиск производился с помощью поисковой системы SRS (Sequence Retrieval System)

    Таксон Запрос Количество найденных документов
    Археи (Archaea) No entries found — please try again. 0
    Бактерии (Bacteria) Query "((((([uniprot-Description:Transcription*] & [uniprot-Description:termination*]) & [uniprot-Description:factor*]) & [uniprot-Description:rho*]) | [uniprot-Description:Transcription termination factor rho*] ) & [uniprot-Taxonomy:Bacteria*]) " found 140 entries 140
    Эукариоты (Eukaryota) Query "((((([uniprot-Description:Transcription*] & [uniprot-Description:termination*]) & [uniprot-Description:factor*]) & [uniprot-Description:rho*]) | [uniprot-Description:Transcription termination factor rho*] ) & [uniprot-Taxonomy:Eukaryota*]) " found 1 entries 1


    © Бурлин Антон, 2005