Банки данных Swiss-Prot и UniProt

Второй семестр

Данные банка Swiss-Prot о белке CYOB_ECOLI

Характеристика Метка поля Запись
Внутренний уникальный постоянный идентификатор документаACP18401
Стандартное имя последовательности (идентификатор последовательности)IDCYOB_ECOLI
Название белка, отражающее его функции DEУбиквинол оксидаза полипептид I (EC 1.10.3.-), Цитохром o субъединица 1, Оксидаза BO(3) субъединица 1, Цитохром o убиквинол оксидаза субъединица 1, Убиквинол оксидаза цепь A
Дата создания документаDT01 ноября 1990
Дата последнего исправления аннотацииDT01 мая 2005
Название организмаOS Escherichia coli, Escherichia coli O6,Escherichia coli O157:H7
Полное название таксонаOCBacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia
Длина последовательностиSQ663 а.о.
Молекулярная масса белкаSQ74368 а.е.м.
Число публикаций, использованных при создании документаRN10
Название журнала с самой свежей публикацией RLProc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99:17020-17024 (2002)
Описание вторичной структурыFTальфа-спирали, повороты, бета-тяжи, номера начальных и конечных аминокислотных остатков
Содержание поля комментариевCC Функции, каталитическая активность, кофактор, местоположение, структура, систематика, транспорт
Особенности последовательностиFTэффекты мутаций, ионы металлов, домены, трансмембранные единицы, связь, образовавшаяся после трансляции (1'-histidyl-3'-tyrosine (His-Tyr))
Идентификатор файла PDB DR1FFT

Ссылка на документ банка данных Swiss-Prot

Результаты поиска в БД UniProt белков с тем же кратким описанием (DE), что и у белка CYOB_ECOLI

ЗапросArchaea (поле Taxonomy)Bacteria (поле Taxonomy)Eukaryota (поле Taxonomy)
Ubiquinol oxidase polypeptide I (поле Description)060
Таксон Запрос Количество найденных документов
Бактерии (Bacteria) "((((([uniprot-Description:Ubiquinol*] & [uniprot-Description:oxidase*]) & [uniprot-Description:polypeptide*]) & [uniprot-Description:I]) | [uniprot-Description:Ubiquinol oxidase polypeptide I*]) & [uniprot-Taxonomy:Bacteria*])" 6

Поиск проводился с помощью поисковой системы SRS (Sequence Retrieval System).

Страница SRS

Второй семестр


© Снегирёв Александр, 2005