На главную страницу первого семестра

Описание пространственной структуры ACRB_ECOLI по данным банка PDB, код 1OYD

-Белок: Acriflavine resistance protein B
Pdb-код: 1oyd
-Метод определения структуры-PCA; разрешение-3.80Å
-Диаметр белка – 141,362Å, или 141,362*10-10м, или 0,0070681 длины кишечной палочки.
На этом рисунке изображена 3-х доменная молекула белка и лиганд DEQUALINIUM.
load H:\Term1\CreditWorks\Work2\ACRB~biounit.pdb
script H:\Term1\CreditWorks\Work2\1oyd.def

select protein 
wireframe off
backbone 20
select deq
wireframe 70
rotate y 90
center selected
pause
zoom 300
select cont_acrb_deq
wireframe 50
pause
select within(4.5,deq)
cpk 200
select deq
cpk 70
wireframe 70
pause
restrict deq, cont_acrb_deq
pause
zoom 400
select ASP99:a.od1
label % AA1
select ALA385:a.o
label % AA2
set fontsize 10

Перед вами текст скрипта, генерирующего изображения связи белка с лигандом.

© Яковлев Сергей,2004