Общее знакомство со структурой GO

1.Белок	RIR2_ECOLI
2.Термин по-русски	Репликация ДНК, синтез РНК праймера
3.Термин по-английски	DNA replication, synthesis of RNA primer
4.Идентификатор GO	0006269
5.Количество синонимов	None
6.Определение термина	Создание РНК праймера связанной с коротким сегментом на отстающей реплицируюшейся ДНК с помощью ДНК полимеразы альфа.
7.Количество родителей	part_of: 1 is_a: 0
8.Количество дочерних терминов	is_a: 0 part_of: 0

Связь is_a означает, что родительский термин является более общим термином, чем дочерний, например, DNA replication is_a DNA metabolism
Связь part_of означает, что процесс, характеризуемый дочерним термином, является составной частью процесса, характеризуемого родительским, например, DNA strand elangation part_of DNA-depend DNA replication.

Протеом Rattus norvegicus. Результаты поиска в UniProt, 16.03.2006 г.

Группа белков протеома	Количество белков	Запрос
Все	14803	(([uniprot-Organism:Rattus] & [uniprot-Organism:norvegicus]) \| [uniprot-Organism:Rattus norvegicus*])
С идентификаторами всех 3-х онтологий GO	3063	((([uniprot-Organism:Rattus] & [uniprot-Organism:norvegicus]) \| [uniprot-Organism:Rattus norvegicus]) & (([uniprot-DBxref_:C:] & [uniprot-DBxref_:P:]) & [uniprot-DBxref_:F:]))
В том числе в мембране	891	(((([uniprot-Organism:Rattus] & [uniprot-Organism:norvegicus]) \| [uniprot-Organism:Rattus norvegicus]) & (([uniprot-DBxref_:C:] & [uniprot-DBxref_:P:]) & [uniprot-DBxref_:F:])) & [uniprot-DBxref_:GO:0016020*])
В том числе только с самыми хорошими доказательствами функции	8	((((([uniprot-Organism:Rattus] & [uniprot-Organism:norvegicus]) \| [uniprot-Organism:Rattus norvegicus]) & (([uniprot-DBxref_:C:] & [uniprot-DBxref_:P:]) & [uniprot-DBxref_:F:])) & [uniprot-DBxref_:GO:0016020]) & (([uniprot-DBxref_:TAS.] \| [uniprot-DBxref_:IDA.]) ! (((((([uniprot-DBxref_:IMP.] \| [uniprot-DBxref_:IGI.]) \| [uniprot-DBxref_:IPI.]) \| [uniprot-DBxref_:ISS.]) \| [uniprot-DBxref_:IEP.]) \| [uniprot-DBxref_:NAS.]) \| [uniprot-DBxref_:IEA.])))
В том числе только с самыми плохими доказательствами функции	873	((((([uniprot-Organism:Rattus] & [uniprot-Organism:norvegicus]) \| [uniprot-Organism:Rattus norvegicus]) & (([uniprot-DBxref_:C:] & [uniprot-DBxref_:P:]) & [uniprot-DBxref_:F:])) & [uniprot-DBxref_:GO:0016020]) & ([uniprot-DBxref_:IEA.] ! ((((((([uniprot-DBxref_:IMP.] \| [uniprot-DBxref_:IGI.]) \| [uniprot-DBxref_:IPI.]) \| [uniprot-DBxref_:ISS.]) \| [uniprot-DBxref_:IEP.]) \| [uniprot-DBxref_:NAS.]) \| [uniprot-DBxref_:TAS.]) \| [uniprot-DBxref_:IDA.])))

В качестве хороших доказательств рассматривались обоснования с кодами IDA и TAS, то есть вёлся поиск белков, охарактеризованных только этими терминами GO.
За плохие доказательства рассматривались обоснования с кодами IEA.

На главную страницу.