Эволюционная модель

Дерево, построенное по заданной скобочной формуле, где расстояния указаны как число мутаций на 100 п.н., (узлы обозначены цифрами 1,2,:). Скобочная формула: (А:100,((В:50,(С:23,D:23):27):10,(Е:33,F:33):37):30)

Длинна гена: 624 нуклеотида.

msbar ecalvb.fasta 2.fasta -point 4 -count 187 -auto
msbar 2.fasta 3.fasta -point 4 -count 62 -auto
msbar 3.fasta 4.fasta -point 4 -count 168 -auto
msbar 2.fasta 5.fasta -point 4 -count 231 -auto
msbar ecalvb.fasta A.fasta -point 4 -count 624 -auto
msbar 3.fasta B.fasta -point 4 -count 312 -auto
msbar 4.fasta C.fasta -point 4 -count 144 -auto
msbar 4.fasta D.fasta -point 4 -count 144 -auto
msbar 5.fasta E.fasta -point 4 -count 206 -auto
msbar 5.fasta F.fasta -point 4 -count 206 -auto

Параметр -point указывает тип изменений в последовательности, в которую надо внести мутации, а значение 4 означает, что будут изменены нуклеотиды, а не, допустим, произойдет их удаление, а параметр -auto предполагает все остальные параметры по умолчанию.

Описание модельного филогенетического дерева