Метаболические пути. KEGG.

Поиск по названиям субстрата и продукта ферментативной реакции.

Субстрат: L-Homoserine O-Phospho-L-homoserine
Продукт: O-Phospho-L-homoserine
Уравнение реакции ("definition"):
ATP + L-Homoserine <=> ADP + O-Phospho-L-homoserine
Изображение реакции с помощью структурных формул:

Название фермента:
homoserine kinase;
homoserine kinase (phosphorylating);
HSK.

Код фермента и его расшифровка: 
2.7.1.39
2. Transferases
2.7. Transferring phosphorus-containing groups
2.7.1. Phosphotransferases with an alcohol group as acceptor
2.7.1.39 Homoserine kinase

226 генов, которые по данным KEGG являются ортологами гену изучаемого фермента
Название метаболического пути:
Glycine, serine and threonine metabolism
В пределах данного метаболического пути этот субстрат мог появился из L-Asparatate 4semialdehyde
Дальше заданный продукт может превратиться в Threonine

Поиск на карте и описание случая, когда ферменты разного типа катализируют одну и ту же реакцию.

Название метаболического пути: Fructose and mannose metabolism
По второму запросу находятся документы в названиях которых есть не толко название метаболического пути, но и указание на то, что это карта ссылок. Поэтому находится только один документ. А в первом случаи находятся все документы, в названии которого есть название этого метаболического пути.

Код ЕС	2.7.7.22	3.6.1.21
Реакция	GDP + D-Mannose 1-phosphate <=> Orthophosphate + GDPmannose	GDPmannose + H2O <=> GMP + D-Mannose 1-phosphate
Имя	mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP); GDP mannose phosphorylase; mannose 1-phosphate (guanosine diphosphate) guanylyltransferase; GDP-mannose 1-phosphate guanylyltransferase; guanosine diphosphate-mannose 1-phosphate guanylyltransferase; guanosine diphosphomannose phosphorylase; mannose 1-phosphate guanylyltransferase; GDP:D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase	ADP-sugar diphosphatase; ADP-sugar pyrophosphatase; adenosine diphosphosugar pyrophosphatase
Объяснение кода ЕС	Transferases Transferring phosphorus-containing groups Nucleotidyltransferases	Hydrolases Acting on acid anhydrides In phosphorus-containing anhydrides
Кол-во извесных реакций в котором этот фермент участвует	1 реакция [RN:R00883]	6 реакций [RN:R00881 R00951 R01233 R01885 R02677 R03570]
Карты, в которых есть этот фермент	PATH: map00051 Fructose and mannose metabolism	PATH: map00051 Fructose and mannose metabolism PATH: map00230 Purine metabolism PATH: map00500 Starch and sucrose metabolism

Cравнение метаболических путей у разных организмов.

Биосинтез треонина из гомосерина (homoserine) у человека (Homo sapiens) и E.coli K-12.
Glycine, serine and threonine metabolism
Homo sapiens

E.coli K-12
Фрагментсодержит две реакции
Как видно из рисунков, по современным данным человеческий организм не способен синтезировать трионин, поэтому, в отличии от бактерии E.coli K-12, человеку необходимо получать его вместе с пищей