Kodomo

Пользователь

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2012

Семестр I. Объекты и инструменты

Расписание (проект)

Результаты (Только для студентов этого года и преподавателей!)

Блок 1: Linux, FAR Manager, интернет, HTML

1. Что такое биоинформатика?

А. Алексеевский

[презентация] [задания] [подсказки] [CRISPR]

2. Среда для работы: FAR (под Windows) и Linux

А. Алексеевский

[задания] [подсказки] [белок для работы] [инструкция по FAR]

[минимум по FAR для зачёта]

3. GNU/Linux

Ю. Коростелёв, А. Алексеевский

[задания] [подсказки] [шпаргалка]

4. Интернет

Ю. Коростелёв, А. Алексеевский

[задания, подсказки] [бактерия для работы]

5. Создание Web-страничек

Ю. Коростелёв, С. Митрофанов, А. Алексеевский

[презентация] [задания] [HTML справка] [CSS справка] [Ещё одна справка] [Страничка из лекции] [Стиль из лекции]

6. Создание Web-страничек

С. Митрофанов, А. Алексеевский

[зачетное задание] [правила зачета по блоку] [Пример использования css] [Пример верстки таблицей] [Пример расположения элементов на странице]

[Кто кого проверяет] [Форма для оценки персональных сайтов] [Список выставленных оценок]

Каждый студент оценивает персональные сайты пяти однокурсников (см. Кто кого проверяет). Ссылка на форму для внесения оценок приведена выше.

7. Зачёт по FAR, по Linux и по порядку в директориях

С. Митрофанов, А. Алексеевский

[Минимум по Linux (bash)] [Минимум по FAR Manager] [Требования к файлам и директориям]

Образцы бывших мини-контрольных

[миниКР 1] [миниКР 2] [данные для миниКР 2] [миниКР 3] [миниКР 4]

Блок 2: Jmol: Введение в молекулярную структурную биологию

[16.12.2012] Страница обновлена, ознакомьтесь, пожалуйста [Про баллы и получение зачета за блок]

8. Трехмерная структура белка: визуализация с помощью программы Jmol

Д. Диброва, С. Митрофанов, А. Алексеевский

[презентация] [задания] [подсказки] [PDB-файл 4ASU]

[Общие требования к оформлению протоколов]

9. Химическая структура и свойства аминокислот. ChemSketch для рисования структур молекул

Д. Диброва, С. Митрофанов, А. Алексеевский

[презентация] [задания] [подсказки] [условия контрольной для занятия №10]

10. Белок «сам с собой»: гидрофобные взаимодействия, водородные связи, солевые мостики

Д. Диброва, С. Митрофанов, А. Алексеевский

[презентация] [задания] [подсказки]

11. Белок и «лиганд»: с чем, как и зачем может взаимодействовать белок

Д. Диброва, С. Митрофанов, А. Алексеевский

[презентация] [задания] [подсказки]

12. База данных трехмерных структур PDB (Protein Data Bank)

Д. Диброва, С. Митрофанов, А. Алексеевский

[презентация]

Блок 3: Электронные таблицы

13. Электронные таблицы (MS-Excel)

С.А. Спирин

[задания] [подсказки]

14. MS-Excel (продолжение)

С.А. Спирин

[задания] [подсказки]

15. MS-Excel (контрольная работа)

С.А. Спирин

[задание]