Содержание и метки полей записи банка UniProt

Code
(метка)

Content

Description

Описание

ID

Identification

Contains identifying information and characteristics of the sequence

Идентификатор последовательности, часто кодирует биологически осмысленную информацию, меняется от выпуска к выпуску БД

AC

Accession number(s)

Release-to-release stable identifiers

"Код доступа" — уникальный идентификатор последовательности, не меняющийся от выпуска к выпуску БД

DT

Date

When the entry was created, or when the sequence or annotation was modified

Дата создания записи и последней модификации

DE

Description

The name of the protein, often a function indicator

Название (краткое описание) белка, часто указывающее на его функцию

GN

Gene name(s)

The gene(s) that code for the protein

Имя гена (-ов), кодирующего белок

OS

Organism species

The organism from which the sequence is derived

Организм, в котором найден белок

OG

Organelle

If the sequence is non-chromosomal in origin

Если ген белка не находится в хромосоме

OC

Organism classification

The taxonomic class to which the organism belongs

Полная таксономия организма

OX

Taxonomy cross-reference(s)

The NCBI TaxID for the OC line

Идентификатор таксона

RN

Reference number

The sequential number of the literature citation within the entry

Номер ссылки на научную публикацию

RP

Reference position

The type of data, and the position in the sequence to which the citation refers

Тип информации в данной ссылке и фрагмент последовательности, к которому она относится.

RC

Reference comment(s)

Comments relevant to the reference cited

Комментарии к цитируемой работе

RX

Reference cross-reference(s)

Bibliographic cross-reference, such as PubMed ID

Библиографические перекрестные ссылки, например, идентификатор PubMed

RA

Reference authors

Authors of the citation

Авторы публикации

RT

Reference title

Title of the citation

Название статьи

RL

Reference location

Source of the citation, such as journal, book, or unpublished data

Журнал, книга или устное сообщение

CC

Comments or notes

Free text notes about the protein

Комментарии

DR

Database cross-references

Pointers to sources or related information for the entry

Гиперссылки на соответствующие записи
других БД

PE

Protein existence

Gives indication on the evidences that we currently have for the existence of a protein

Как получена информация о существовании данного белка

KW

Keywords

Indexable indicator of function, structure, or other information

Ключевые слова (индексируемый
предметный указатель)

FT

Feature table data

Annotation of specific residues of the sequence

Описание особых позиций в последовательности, особенности последовательности

SQ

Sequence header

Marks the beginning of the sequence and provides summary data

Метка начала последовательности и некоторых ее
общих свойств (в частности, молекулярной массы)

(blanks)

Sequence data

The sequence itself

Аминокислотная последовательность

//

Termination line

   

Дополнительно:

  1. В поле комментариев после "-!-" указывается тема комментария
  2. The format of a comment block is:
    
    CC   -!- TOPIC: First line of a comment block;
    CC second and subsequent lines of a comment block.
    
    
  3. В поле FT указывается тип особенности (Key name) и координаты (начало, конец) данной особенности в последовательности:
    FT    Key name    'From' endpoint    'To' endpoint