Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2007

Cеместры Студенты Преподаватели
 
 
На главную страницу
 
  2006
  2005
  2004
  2003
2002

Cеместр III. Последовательности и структуры нуклеиновых кислот

Студенты учатся работать с банками нуклеотидных последовательностей, знакомятся с пространственными структурами нуклеиновых кислот, учатся сравнивать нуклеотидные последовательности, а также получают первое представление о методах поиска кодирующих участков и слабых сигналов в последовательностях НК.
 

Блок 1: структуры нуклеиновых кислот

1.

Нуклеиновые кислоты, строение и структура (лекция)

1, 2 сентября, А.Б.Рахманинова, А.В.Головин
[презентация] 
[упражнения] [материалы к упражнениям]
[задания к отчету]
[дополнительная литература]

2.

Разбор заданий. Тест "Химическое строение нуклеиновых кислот"

8,9 сентября, А.Б.Рахманинова, А.В.Головин, О.Занегина
[вопросы теста]

3.

Обсуждение заданий. Тест "Структура нуклеиновых кислот"

15, 16 сентября, А.Б.Рахманинова, А.В.Головин, О.Занегина
[вопросы теста]

4.

Итоговая контрольная работа.
Обсуждение проблем при подготовке отчета.

22, 23 сентября, А.Б.Рахманинова, А.В.Головин, О.Занегина
[задания контрольной]

5.

ДНК-связывающие белки (лекция). Обсуждение результатов.

29, 30 сентября, А.Б.Рахманинова, А.В.Головин, О.Занегина

Правила получения зачета за первый блок.

Блок 2: нуклеотидные последовательности

6.

Интерпретатор командной строки bash

6,7 октября, С.А.Спирин
[упражнения]

7.

Банк EMBL

13,14 октября, С.А.Спирин
[упражнения]  [презентация]

8.

Программы пакета BLAST (лекция)

21,27 октября, С.А.Спирин
[упражнения]  [материалы]

9.

Пакет BLAST (продолжение)

28 октября, 3 ноября, С.А.Спирин
[упражнения]

10.

Зачётная работа по BLAST (аннотирование участка генома)

10,11 ноября, С.А.Спирин
[задание]

Блок 3: поиск сигналов

12.

Лекция

17,18 ноября, Д.Равчеев
[задания]
со всеми вопросами можно обращаться непосредственно к Дмитрию Андреевичу Равчееву

13.

Разбор заданий (семинар)

24,25 ноября, Д.Равчеев

Блок 4: предсказание генов

14.

Лекция

1,2 декабря, Е.Ермакова
[задания]
со всеми вопросами можно обращаться непосредственно к Екатерине Олеговне Ермакововй

15.

Разбор заданий (семинар)

8,9 декабря, Е.Ермакова

16.

Обсуждение результатов 3-его и 4-го блока (семинар)

15,16 декабря



Зачёт (для обеих групп):
23 декабря (вторник) с 15:30 до 19:00;
24 декабря (среда) с 15:00 до 17:10.

Задание контрольной по bash