Требования к формату и содержанию файла report.txt    
 

 

Формат текстовой, используйте кодировку кириллицы для Windows.

В каждом пункте пишете название пункта, затем приводите соответствующие данные и , наконец, кратко указываете, откуда и как Вы их получили, где преподаватель может найти обоснование приведенных данных.

Примеры:

4. Название гена - хххХ (дано преподавателем)
.........
7. Длина последовательности - 127 а.о. (подсчет с помощью Excel, см. книгу AA.xls, лист "aa_freq")


   
  Содержание отчета :    
  Отчет студента <имя> группы П<номер> за первый блок первого семестра курса биоинформатики    
 
  1. Полное название ("description") белка
  2. Краткое название белка
  3. Полное название организма
  4. Название гена
  5. Номер локуса в бактериальной хромосоме
  6. Полный путь к файлу, в котором записана аминокислотная последовательность Вашего белка в формате FASTA
  7. Длина последовательности (в а.о.)
  8. Аминокислотный состав белка (в долях):
    А (аланин) 0,091
    С (цистеин)
    .....
  9. Молярная масса
  10. Относительное содержание гидрофобных и гидрофильных аминокислотных остатков в белке ......., протеоме Escherichia coli K-12 и в транспортных белках класса ТС.2.А. Объясните, какой параметр Вы вычисляли, приведите все 3 значения, сделайте выводы из их сравнения.
  11. Средний электрический заряд белка:.. при 3-х значениях рН
  12. Качественное сравнение аминокислотного состава белка ... , среднего состава протеома E.coli и равномерного распределения (описание Ваших наблюдений, сделанных на основании построенной смешанной диаграммы.