Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2005
 
   
Семестры   Студенты   Преподаватели
 
 
 
Главная страница
 
2004
2003
2002
 
 
     
 

Cеместр 3: Нуклеиновые кислоты

 
 

Студенты учатся работать с банками нуклеотидных последовательностей, с пространственными структурами нуклеиновых кислот, а также получают первое представление о методах поиска кодирующих участков и слабых сигналов в последовательностях НК.

 
 
Блок 1: Последовательности нуклеиновых кислот
     
  1 Работа в командной строке UNIX
  5 сентября, АБР+САС
  [задания] [материалы]
 
  2 Банк EMBL
  12 сентября, АБР+САС
  [задания] [подсказки] [презентация]
 
  3 Пакет BLAST (работа из командной строки).
  19 сентября, АБР+САС
  [задания] [подсказки]
 
  4 Поиск сходных нуклеотидных последовательной, не кодирующих белки.
  26 сентября, АБР+САС
  [задания] [подсказки]
 
  [правила зачета за блок 1]
 
  5 Аннотирование фрагмента генома Klebsiella pneumoniae (зачетное занятие)
  3 октября, АБР+САС
 

[задания] [подсказки] [фрагменты для аннотации]  

[результаты контрольной работы "Номенклатура НК"]

 

Блок 2: Структуры нуклеиновых кислот
 
  6 Работа в ChemSketch: построение фрагмента ДНК
  10 октября, АВГ+АБР+САС
 

[задания] [подсказки] [презентация]

 

  7 Работа с RasMol и 3DNA: анализ структур A- и B-форм ДНК
  17 октября, АБР+САС
 

[задания] [подсказки]

 

  8 Структура РНК
  24 октября, АВГ+АБР
 

[задания] [подсказки] [презентация]

 

  9 Белок-нуклеиновые контакты
  31 октября, АВГ+АБР
 

[задания] [материалы]

 

  10 Контрольная работа по блоку 2
  7 ноября
 

 

Блок 3: Предсказание генов
 
  11 Предсказание генов (лекция)
  14 ноября, М.С.Гельфанд
 

[презентация]

 

  12-13 Предсказание генов
  21 и 28 ноября, Е.Ермакова, С.А.С.
 

[задания]

 

Блок 4: Поиск сигналов
 
  14 Поиск регуляторных сигналов (лекция)
  5 декабря, М.С.Гельфанд
 

[просмотр презентации]  [скачать презентацию]

 

  15 Поиск регуляторных сигналов (практикум)
  12 декабря, А. Герасимова
 

[задания и инструкции (файл в формате MS-Word)]